两个公职人员借用种植专业合作社的名义借款，这一行为是否合法，需要具体问题具体分析。从一般原则上来看，公职人员应当严格遵守国家法律法规和职业道德规范，不得利用职权或职务之便谋取私利，也不得滥用职权或职务上的影响为本人或他人谋取不正当利益。
首先，如果这两个公职人员以种植专业合作社的名义借款，但实际上是为了个人利益或私人用途，而非合作社的正常经营需要，那么这种行为很可能构成违法。因为这种行为可能涉嫌滥用职权、挪用公款或诈骗等违法犯罪行为。
其次，即使公职人员以合作社名义借款是为了合作社的经营需要，但如果借款过程中存在不正当手段或违规行为，如虚构借款用途、伪造借款材料等，也同样可能构成违法。
针对这种情况，建议采取以下处理措施：
调查核实：相关部门应尽快对公职人员的借款行为进行调查核实，了解借款的真实用途、资金来源和去向，以及是否存在违规行为。
依法处理：如果调查发现公职人员的借款行为存在违法违规行为，应依法进行处理。根据情节的严重程度，可能涉及行政处分、刑事处罚等法律责任。
加强监管：对于公职人员的类似行为，应加强监管和防范。建立健全相关制度，明确公职人员的行为规范和法律责任，加强对其日常行为的监督和约束。
警示教育：通过典型案例进行警示教育，提醒公职人员时刻保持清醒头脑，严格遵守法律法规和职业道德规范，不得利用职权或职务之便谋取私利。
综上所述，两个公职人员借用种植专业合作社的名义借款是否合法，需要根据具体情况进行判断。如果涉及违法违规行为，应依法进行处理，并加强监管和警示教育，以防止类似问题的再次发生。