关于电梯安装门禁卡（梯控系统）是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况和相关法律法规来综合判断。

首先，我们要明确的是，电梯作为住宅小区内的共有部分，其使用和管理应当遵循业主的共同意愿和决定。根据《民法典》第278条以及《物业管理条例》的相关规定，对于共有部分的管理和改造，通常需要经过业主大会的讨论和决定，并且需要得到超过一定比例（如三分之二）的业主同意。

如果物业公司在未经过业主大会讨论和决定，也未得到足够比例业主同意的情况下，私自安装电梯梯控系统，那么这一行为很可能是违法的。 这种行为侵犯了业主的合法权益，因为业主对电梯这一共有部分享有使用权，物业无权擅自进行限制或改造。

然而，如果物业公司能够证明其安装梯控系统的行为是出于保障小区安全、防止外来人员随意进出等合理目的，并且在安装前已经通过合理的方式征求了业主的意见，得到了足够比例业主的同意，那么这一行为可能是合法的。但即便如此，物业公司也需要确保梯控系统的安装不会给业主的日常生活带来不必要的困扰和安全隐患。

从实际操作和安全隐患的角度来看，梯控系统的安装确实可能带来一些问题。例如，它可能增加电梯的运行次数，因为业主需要刷卡才能乘坐电梯，并且电梯可能只能停靠刷卡层。此外，梯控系统还可能存在安全隐患，如电梯轿厢内无手机信号覆盖时，遇紧急情况或电梯故障时业主可能无法及时求助。

因此，我的建议是：

1. 物业公司应当尊重业主的权益，在安装梯控系统前充分征求业主的意见，并确保得到足够比例业主的同意。
2. 物业公司应当确保梯控系统的安装不会给业主的日常生活带来不必要的困扰和安全隐患。例如，可以优化梯控系统，使得在紧急情况下电梯能够正常停靠；或者为业主提供其他便捷的通行方式。
3. 如果业主对梯控系统的安装存在异议，可以通过业主大会或业主委员会等渠道与物业公司进行沟通协商，寻求合理的解决方案。

综上所述，电梯安装门禁卡（梯控系统）是否合法取决于具体情况和相关法律法规的遵循情况。物业公司应当尊重业主的权益，确保安装行为的合法性和合理性。