关于租房合同正本由谁拿着的问题，这主要取决于租赁双方的具体约定以及实际操作中的习惯做法，但通常来说，租房合同正本应由租赁双方各自持有一份。以下是对此问题的详细解答：

一、合同正本持有原则

1. 平等原则：在租赁关系中，出租人和承租人处于平等地位，双方都有权持有合同正本，以维护各自的合法权益。
2. 便利原则：持有合同正本可以方便双方随时查阅合同条款，了解各自的权利和义务，以及在需要时作为证据使用。

二、实际操作中的习惯做法

1. 各自持有一份：在大多数情况下，租赁双方会各自持有一份合同正本。这样，无论哪一方需要查阅合同或作为证据使用，都可以方便地找到合同原件。
2. 共同保管或第三方保管：在某些特殊情况下，如双方信任度较高或合同涉及重要事项时，双方可能会选择共同保管合同正本，或者将合同正本交由第三方（如中介机构）保管。但这种情况相对较少，且需要双方达成一致意见。

三、合同备案与持有关系

1. 备案义务：根据相关规定，住房租赁合同订立后，相关当事人需及时向住建主管部门办理备案手续。备案行为不影响住房租赁合同的法律效力，且全程免费办理。
2. 备案与持有：备案是合同生效后的一个法定程序，与合同正本的持有无直接关系。无论合同是否备案，租赁双方都有权持有合同正本。

四、建议与注意事项

1. 明确约定：在签订租赁合同时，双方应明确约定合同正本的持有方式，以避免后续产生纠纷。
2. 妥善保管：无论哪一方持有合同正本，都应妥善保管，防止合同丢失或损坏。
3. 及时备案：为了保障双方的合法权益，建议租赁双方在签订合同后及时办理备案手续。

综上所述，租房合同正本应由租赁双方各自持有一份，这是基于平等原则和便利原则的考虑。在实际操作中，双方可以根据具体情况和信任度选择共同保管或第三方保管的方式，但应明确约定并妥善保管合同正本。同时，为了保障双方的合法权益，建议及时办理合同备案手续。