要证明一份已经签过字的文件是否被改动过，这确实是一个涉及法律证据和文件鉴定的问题。以下是一些详细且深入的解答步骤，希望能帮助您更好地理解和处理这个问题：

一、理解文件改动的基本概念

文件改动可能包括添加、删除、修改或替换文件中的部分内容。这些改动可能影响文件的真实性、完整性和法律效力。因此，证明文件是否被改动过，对于维护各方权益至关重要。

二、识别文件改动的迹象

1. 观察文件外观：

   • 检查文件是否有刮擦、消褪、拼接等异常痕迹。
   • 观察字迹的排版布局是否自然，有无突兀或不一致之处。

2. 对比字迹特征：

   • 如果怀疑文件中的某部分字迹是后来添加的，可以对比该部分字迹与其他部分字迹的书写风格、墨水颜色、笔压等特征。
   • 使用文检仪等专门设备，对字迹进行吸收及反射特性检验，以发现不同字迹之间的差异。

三、寻求专业鉴定

1. 选择鉴定机构：

   • 寻找具有合法资质和丰富经验的文件鉴定机构。
   • 确保鉴定机构具备进行笔迹鉴定、篡改（污损）文件鉴定等相关项目的资质。

2. 提交鉴定申请：

   • 向鉴定机构提交需要鉴定的文件原件或复印件。
   • 提供与文件相关的背景信息，如文件的形成时间、地点、涉及人员等。
   • 明确鉴定请求，即证明文件是否被改动过，以及改动部分的具体内容。

3. 配合鉴定过程：

   • 按照鉴定机构的要求，提供必要的比对样本，如签名样本、书写习惯样本等。
   • 配合鉴定机构进行现场勘验、询问等工作。

4. 获取鉴定意见：

   • 鉴定机构将出具鉴定意见，明确文件是否被改动过，以及改动部分的具体情况。
   • 鉴定意见将作为法律证据，用于维护您的合法权益。

四、法律途径

1. 诉讼或仲裁：

   • 如果文件改动涉及法律纠纷，您可以考虑通过诉讼或仲裁等法律途径解决。
   • 在诉讼或仲裁过程中，鉴定意见将作为重要证据，用于证明文件是否被改动过。

2. 举证责任：

   • 根据法律规定，主张文件被改动的一方通常需要承担举证责任。
   • 因此，您需要积极收集证据，包括鉴定意见、证人证言等，以支持您的主张。

五、预防措施

1. 加强文件管理：

   • 建立完善的文件管理制度，确保文件的真实性、完整性和安全性。
   • 对重要文件进行备份和存档，以备不时之需。

2. 提高法律意识：

   • 增强法律意识，了解文件改动的法律后果和风险。
   • 在签订文件时，务必仔细阅读文件内容，确保自己的权益得到保障。

六、实际案例参考

以您提供的案例为例，如果B公司怀疑A公司出具的《证明》被改动过，特别是“153”中的“1”是后来添加的，B公司可以向法院提出鉴定申请。法院将委托具有合法资质的鉴定机构对《证明》进行鉴定。鉴定机构将通过文检仪等设备对字迹进行吸收及反射特性检验，以判断“1”与“53”是否为同一支笔书写形成。如果鉴定意见表明“1”是后来添加的，那么该鉴定意见将被司法机关采纳，作为证明文件被改动过的证据。

综上所述，要证明一份已经签过字的文件是否被改动过，您需要仔细观察文件外观、对比字迹特征、寻求专业鉴定、通过法律途径解决纠纷，并采取预防措施以降低风险。希望这些解答步骤能对您有所帮助。