在交通事故中，您承担次要责任且保险公司已赔偿的情况下，次责部分若想走医保报销，需分情况处理：

1. 医保报销的基本原则
   医保主要覆盖因疾病或非第三方责任导致的医疗费用。若医疗费用已由第三方（如对方保险公司）赔偿，医保通常不再重复报销。这是基于《社会保险法》第三十条的规定，明确医疗费用依法应当由第三人负担的，不纳入基本医疗保险基金支付范围。

2. 若对方未完全赔偿或存在自费项目

   • 未赔偿部分：若对方保险公司未全额赔偿（如超出保险限额、免赔额等），您可凭医疗费用发票原件、事故责任认定书、保险公司定损单等材料，向医保部门申请报销剩余部分。
     
   • 自费项目：若治疗中使用了医保目录外的药品或项目（如进口器材、特效药等），这部分费用需自行承担，但若您购买了商业医疗保险（如百万医疗险），可尝试通过商业保险报销。

3. 操作步骤与注意事项

   • 保留完整材料：包括医疗发票、费用清单、诊断证明、事故责任认定书、保险公司赔偿凭证等，这些是申请医保报销的关键证据。
     
   • 主动申报：向当地医保部门说明事故情况，并提交材料申请报销。部分地区可能要求填写《第三方责任不支付情况说明》或类似文件。
     
   • 避免重复报销：若医保部门发现费用已由第三方赔偿，可能拒绝报销。因此，需如实说明赔偿情况，仅申请未覆盖部分。

4. 特殊情况处理

   • 对方逃逸或无力赔偿：若对方未赔偿且无法追责，您可向医保部门申请“无第三方责任”报销，需提供交警出具的事故证明或法院判决书等材料。
     
   • 工伤与医保冲突：若事故属于工伤（如上下班途中发生非本人主要责任的交通事故），应优先通过工伤保险报销，医保不予重复支付。

总结建议：先整理所有医疗费用和赔偿材料，向医保部门咨询具体政策（因地区可能存在差异），再按要求提交申请。若涉及复杂情况（如对方拒赔、自费项目过多），可进一步向我咨询具体应对方案。