核心结论：代理销售造成损失时，向代理商开发票收取赔偿需分情况处理，主要取决于赔偿的性质以及双方事先的约定。以下是具体分析：

1. 若赔偿属于价外费用：

   • 定义与性质：根据相关税法规定，价外费用是指销售方向购买方收取的，除价款以外的各种费用、租金、补贴等。如果代理商因违约或过错导致你方损失，且双方约定该赔偿作为价外费用处理，那么此赔偿应视为销售方收入的一部分。
   • 发票开具：在此情况下，你方应按照正常销售业务开具发票，将赔偿金额包含在发票总额中，并按照相应的税率计算税额。这样，赔偿金额就成为了你方收入的一部分，同时也满足了税务合规的要求。

2. 若赔偿不属于价外费用，而是独立赔偿：

   • 定义与性质：如果双方约定赔偿是独立于销售业务之外的，用于弥补你方因代理商行为所遭受的具体损失（如货物损坏、错发、漏发等导致的直接经济损失），则此赔偿不属于销售方的收入。
   • 发票开具与税务处理：
     • 发票开具：在这种情况下，通常不需要为赔偿金额单独开具发票。因为赔偿并非销售行为，不产生增值税的纳税义务。但是，为了证明赔偿事实和金额，双方可以签订赔偿协议或确认书作为凭证。
     • 税务处理：你方在收到赔偿后，应将其作为营业外收入（如果符合相关条件）或其他收入处理，并在企业所得税申报时进行相应调整。同时，注意保留好相关凭证和资料，以备税务机关查验。

3. 实际操作建议：

   • 明确约定：在代理销售合同中，应明确约定赔偿条款，包括赔偿的范围、标准、支付方式以及税务处理等事项。这有助于减少后续纠纷和税务风险。
   • 保留证据：在发生损失和赔偿时，务必保留好相关证据和资料，如损失清单、赔偿协议、支付凭证等。这些证据将有助于你方在税务机关查验时证明赔偿事实和金额。
   • 咨询专业意见：由于税务处理可能因地区和具体政策而异，建议在处理此类事务时咨询当地税务机关或专业税务顾问的意见，以确保税务合规并降低风险。