检察院免于起诉是否会留下案底，需根据具体情况分析，法定不起诉和证据不足不起诉（若后续无新证据）通常不会留下案底，而酌定不起诉则可能会留下案底记录。以下是对这一问题的详细分析：

一、不起诉决定的类型及与案底的关系

1. 法定不起诉

   • 适用情形：根据《刑事诉讼法》的相关规定，当存在情节显著轻微、危害不大不认为是犯罪；犯罪已过追诉时效期限；经特赦令免除刑罚；依照刑法告诉才处理的犯罪没有告诉或撤回告诉；犯罪嫌疑人、被告人死亡；其他法律规定免予追究刑事责任等情形时，检察院会作出法定不起诉决定。
   • 与案底关系：在这种情况下，由于犯罪嫌疑人不被认为构成犯罪，因此不会留下案底。案底通常指犯罪记录，既然不构成犯罪，自然就不存在犯罪记录。

2. 酌定不起诉

   • 适用情形：酌定不起诉适用于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者可以免除刑罚的情况。此时，虽然检察院决定不起诉，但犯罪嫌疑人的行为已经构成犯罪，只是基于从宽情节等因素考虑而不起诉。
   • 与案底关系：因此，在实践中，酌定不起诉通常会留下案底记录，因为这本质上是对犯罪行为的一种处理，尽管未进入审判阶段，但犯罪事实已被认定。

3. 证据不足不起诉

   • 适用情形：当检察院对于二次补充侦查的案件仍然认为证据不足，不符合起诉条件时，会作出证据不足不起诉的决定。
   • 与案底关系：如果后续没有新的证据表明犯罪嫌疑人有罪，那么在这种情况下，犯罪嫌疑人不被认定构成犯罪，也就不会留下案底。然而，如果未来发现了新的证据足以证明犯罪嫌疑人有罪，诉讼程序可能会被重新启动，此时可能会留下案底。

二、免于起诉的其他影响

• 尽管检察院免于起诉通常不会直接产生犯罪记录（即案底），但这并不意味着没有任何影响。检察院会将不起诉决定书送达给被不起诉人和其所在单位。
• 被不起诉人在日后需要开具无犯罪记录证明时，可能需要对此进行解释和说明。此外，在入党、公务员政审等环节，也可能需要进行特别的说明和审查，尤其是酌定不起诉的情况下。

三、建议与行动

• 了解具体类型：首先，需要了解检察院作出免于起诉决定的具体类型，是法定不起诉、酌定不起诉还是证据不足不起诉。
• 咨询法律专业人士：如果对此类问题存在疑问或担忧，或者需要更详细的法律解释和帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供针对性的法律意见。
• 保留相关证据：无论哪种情况，都建议保留好与案件相关的所有证据和文件，以备不时之需。

综上所述，检察院免于起诉是否留下案底取决于具体的不起诉类型。对于法定不起诉和证据不足不起诉（若后续无新证据），通常不会留下案底；而对于酌定不起诉，则可能会留下案底记录。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。