工厂打水井是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及是否取得合法取水许可及是否符合相关规划与环保要求。以下从不同角度为您详细分析：

1. 取水许可制度：

   • 根据《中华人民共和国水法》及相关规定，直接从江河、湖泊或者地下取用水资源的单位和个人，应当按照国家取水许可制度和水资源有偿使用制度的规定，向水行政主管部门或者流域管理机构申请领取取水许可证，并缴纳水资源费，取得取水权。因此，工厂若未取得取水许可证而擅自打水井取水，属于违法行为。
   • 取水许可证的申请流程通常包括提交申请材料、水行政主管部门或流域管理机构审查、现场勘查、批准或不予批准等步骤。工厂需确保申请材料的真实性和完整性，并按照规定的程序进行申请。

2. 规划与环保要求：

   • 工厂打水井还需符合当地的城乡规划、水资源保护规划以及环保要求。例如，水井的位置应避开饮用水水源保护区、自然保护区等敏感区域，且打井过程中应采取必要的环保措施，防止对地下水环境造成污染。
   • 若工厂打水井违反了相关规划或环保要求，即使取得了取水许可证，也可能面临行政处罚或责令整改等法律后果。

3. 特殊情况下的例外：

   • 在某些特殊情况下，如家庭生活和零星散养、圈养畜禽饮用等少量取水的，可能不需要申请取水许可证。但工厂作为生产经营单位，其取水行为通常不属于此类例外情况。

法律建议：

• 工厂在打算打水井前，应首先咨询当地的水行政主管部门或流域管理机构，了解取水许可的申请流程、所需材料以及相关规划与环保要求。
• 确保打水井的行为符合所有相关法律法规的规定，避免因违法取水而面临法律风险。
• 若已存在未经许可擅自打水井的情况，应立即停止违法行为，并主动向相关部门报告，积极配合整改，以减轻可能的法律后果。

可能法律后果：

• 若工厂未经许可擅自打水井取水，可能面临水行政主管部门的行政处罚，包括罚款、没收违法所得、责令停止违法行为等。
• 若打水井行为对地下水环境造成了污染或破坏，还可能承担环境修复责任或民事赔偿责任。

综上所述，工厂打水井的合法性取决于是否取得合法取水许可及是否符合相关规划与环保要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。