结论前置：房屋买卖合同纠纷自12月31日立案，3月9日开庭，截止7月3日未判决，这种情况在司法实践中是有可能发生的，并不一定意味着存在异常。
详细分析：
案件审理周期：
- 案件的审理周期受多种因素影响，包括案件的复杂程度、法院的工作负荷、法官的审理进度以及当事人是否提出新的证据或申请等。
- 在一些复杂的房屋买卖合同纠纷中，由于涉及的事实认定、法律适用等问题较为复杂，审理周期可能会相对较长。
法院工作流程：
- 法院在审理案件时，需要遵循一定的法律程序和规定，包括开庭审理、证据交换、法庭辩论、合议庭评议等环节。
- 如果案件在审理过程中出现了需要补充调查、鉴定或评估等情况，审理周期也可能会相应延长。
当事人行为：
- 当事人在案件审理过程中的行为也可能影响审理周期。例如，如果当事人提出新的证据或申请，法院可能需要安排额外的开庭或调查程序。
- 如果当事人对判决结果不服并提出上诉，案件将进入二审程序，审理周期也会进一步延长。
法律程序要求：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，人民法院适用普通程序审理的案件，应当在立案之日起六个月内审结。有特殊情况需要延长的，由本院院长批准，可以延长六个月；还需要延长的，报请上级人民法院批准。
- 在您描述的情况下，案件从立案到开庭已经经过了一段时间，但尚未超过法定的审理期限。因此，从法律程序的角度来看，这种情况并不构成异常。
建议与行动：
- 耐心等待：由于案件审理周期受多种因素影响，建议您耐心等待法院的判决结果。
- 主动沟通：如果您对案件的审理进度有疑问或担忧，可以主动与法院联系，了解案件的审理情况。
- 准备后续行动：如果判决结果对您不利或您对判决结果有异议，您可以考虑在法定期限内提出上诉或申请再审等法律救济措施。
总结：房屋买卖合同纠纷自立案到开庭再到判决，整个过程可能因多种因素而延长。在您描述的情况下，案件尚未超过法定的审理期限，因此并不一定意味着存在异常。建议您耐心等待法院的判决结果，并主动与法院沟通了解案件的审理情况。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。