结论：父亲未成年时因聚众斗殴被判刑三年，一般情况下其儿子可以报考国防科技大学，但可能面临政审环节的严格审查，存在一定不被通过的风险。以下从报考国防科技大学的政审要求、父亲犯罪记录对儿子政审的影响等方面进行详细分析：

报考国防科技大学的政审要求

国防科技大学作为军事院校，对考生的政治审查要求较为严格。政审主要是考察考生本人及家庭成员、主要社会关系成员的政治思想表现、遵纪守法情况等。其目的在于确保录取的学生政治可靠、品德优良，能够适应军事院校的学习和未来的军事工作要求。政审内容通常涵盖考生本人的政治态度、思想表现、道德品质、遵纪守法、诚实守信等方面，同时也会对考生的家庭成员和主要社会关系成员进行审查，了解他们是否有危害国家安全、违法犯罪等不良行为。

父亲犯罪记录对儿子政审的影响

• 一般情况：父亲在未成年时因聚众斗殴被判刑三年，这属于有犯罪记录的情况。在政审中，家庭成员的犯罪记录是一个重要的审查因素。不过，由于父亲犯罪时是未成年人，根据我国相关法律规定，对未成年人犯罪记录有一定的封存和保护措施。未成年人的犯罪记录一般情况下会被封存，非司法机关因办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的，不得向任何单位和个人提供。但这并不意味着在政审中完全不会被考虑，政审部门在审查时可能会综合考虑多种因素。
• 综合考量因素：政审并非仅仅依据家庭成员是否有犯罪记录就一票否决。还会考虑犯罪的性质、情节、时间间隔以及考生本人的表现等因素。如果父亲犯罪情节较轻，且距离现在时间较长，在服刑期间表现良好，出狱后也一直遵纪守法，没有再出现违法犯罪行为，同时考生本人政治思想表现优秀、学习成绩优异、品德端正、遵纪守法，那么考生通过政审的可能性相对较大。反之，如果父亲犯罪情节严重，或者出狱后仍有不良行为，那么可能会对考生的政审产生较大的负面影响，导致政审不通过。

建议

如果儿子有报考国防科技大学的意愿，建议提前了解该校的政审具体要求和流程，向当地招生部门或学校咨询相关政策。同时，儿子自身要保持良好的政治思想表现和道德品质，努力学习，提高自身综合素质。在政审过程中，如实提供相关信息，积极配合政审工作。如果对政审结果有异议，也可以按照规定的程序进行申诉。