结论：农民自己开荒的土地在确权时，若未被确认权属，后续是否收费需视具体情况而定，不能一概而论说收费就是合理的。以下从不同角度进行分析：
一、开荒土地的权属问题
权属确认原则：
- 根据相关法律法规，农村土地的权属确认通常遵循“谁开垦、谁使用、谁受益”的原则，但这一原则并非绝对，还需考虑土地的性质、规划以及历史使用情况等因素。
- 开荒土地若未经过合法程序确认权属，其法律地位可能处于不明确状态，这可能导致后续在确权或使用过程中产生争议。
确权程序：
- 确权是确认土地权属的法定程序，通常包括申请、调查、审核、公告、登记等环节。
- 若农民开荒的土地在确权过程中未被确认权属，可能是因为该土地不符合确权条件，如属于集体所有但未分配给个人使用的土地，或者存在权属争议等。
二、未确权土地的收费问题
收费合法性：
- 对于未确权的土地，是否收费并非由单一因素决定，而是需要综合考虑土地的性质、用途、管理规定以及当地政策等因素。
- 若当地政策或法规明确规定对未确权的开荒土地收取费用，且该费用符合法定程序和标准，则收费可能是合法的。但若没有明确的法律依据或政策支持，擅自收费则可能构成违法行为。
收费合理性：
- 即使收费合法，其合理性也需进一步评估。例如，收费标准是否合理、透明，是否考虑了农民的实际负担能力等因素。
- 若收费标准过高或存在不透明、不公平的情况，农民有权提出异议并寻求法律途径解决。
三、农民应对建议
了解当地政策：
- 农民应首先了解当地关于开荒土地确权和收费的具体政策、法规，以便明确自己的权益和义务。
咨询相关部门：
- 若对确权结果或收费问题有疑问，农民可以向当地土地管理部门、农业部门或法律援助机构咨询，获取更详细的信息和专业的建议。
依法维权：
- 若认为确权结果不公或收费不合理，农民可以依法提出申诉或诉讼，维护自己的合法权益。在此过程中，建议寻求专业律师的帮助，以确保维权行动的合法性和有效性。
进一步思考：农民在开荒土地时，应尽可能了解并遵守相关法律法规和政策规定，确保自己的开荒行为合法合规。同时，在确权过程中积极配合相关部门的工作，提供必要的证据和资料，以便顺利确认土地权属。若遇到问题或争议，应及时寻求法律途径解决，避免损失扩大。有问题可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见。