如果单位自查发现征信不好或者有执行民事案件的情况，这可能会对单位的运营、信誉以及法律地位产生一系列的影响。以下是对这一问题的详细解答：
一、征信不好的影响
信贷受限：征信是金融机构评估单位信用状况的重要依据。如果单位征信不佳，银行或其他金融机构可能会拒绝提供贷款、信用证等金融服务，或者提高贷款利率、要求提供更多的担保措施。
合作伙伴信任度下降：征信不良可能影响单位与供应商、客户等合作伙伴的信任关系。合作伙伴可能会对单位的履约能力产生疑虑，从而影响合作关系的稳定性和长期发展。
政府采购、招投标受限：在参与政府采购、招投标等活动中，征信状况往往是重要的评审因素。征信不良可能导致单位失去参与资格或降低中标概率。
二、有执行民事案件的影响
法律责任：如果单位有未执行的民事案件，这意味着单位可能未履行生效法律文书确定的义务，如支付款项、履行合同等。这可能导致单位面临法律制裁，如罚款、拘留等，甚至可能影响单位的法定代表人或主要负责人的个人信用。
声誉损害：执行民事案件的信息通常会被公开，这可能对单位的声誉造成负面影响。公众和合作伙伴可能对单位的诚信度产生质疑，从而影响单位的业务发展和市场竞争力。
业务受限：在某些情况下，有执行民事案件的单位可能会受到行业监管部门的限制或处罚，如限制参与特定行业活动、吊销营业执照等。
三、应对措施
积极履行义务：对于未执行的民事案件，单位应尽快与债权人协商解决方案，积极履行生效法律文书确定的义务，以消除不良影响。
改善征信状况：单位应加强内部管理，规范财务行为，确保按时还款、履行合同等，以逐步改善征信状况。同时，可以积极与金融机构沟通，了解征信修复的具体途径和要求。
加强法律意识：单位应加强对法律法规的学习和了解，确保业务活动合法合规。在签订合同、履行义务等过程中，应充分考虑法律风险，避免产生不必要的纠纷和损失。
寻求专业帮助：如果单位在征信修复或执行民事案件处理方面遇到困难，可以寻求专业律师或征信修复机构的帮助，以获取更具体的指导和支持。
综上所述，单位自查发现征信不好或者有执行民事案件的情况时，应高度重视并积极采取措施加以解决。通过改善征信状况、积极履行义务、加强法律意识和寻求专业帮助等方式，单位可以逐步消除不良影响，恢复信誉和法律地位。