法院在清算公司过程中发现偷税行为的，会依法将线索移送税务机关处理，并可能根据具体情况追究公司及相关责任人的法律责任。具体处理方式如下：

1. 移送税务机关处理
   法院在清算过程中发现公司存在偷税行为的，首先会将相关线索和证据移送至主管税务机关。税务机关将依法启动税务稽查程序，对偷税行为进行调查核实。根据《税收征收管理法》第六十三条，偷税行为包括伪造、变造、隐匿账簿，虚报支出，不缴或少缴税款等，税务机关将追缴税款、滞纳金，并处以罚款（偷税数额50%至5倍）。

2. 追究刑事责任（如构成犯罪）
   若偷税行为情节严重（如数额较大且占应纳税额10%以上），可能构成《刑法》第二百零一条规定的“逃税罪”。此时，税务机关会将案件移送公安机关立案侦查，法院将根据刑事诉讼程序审理。对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，可处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；数额巨大且占应纳税额30%以上的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。

3. 清算程序中的税务优先权
   在清算过程中，公司财产需优先清偿欠缴的税款。根据《公司法》第一百八十六条及《税收征收管理法》第四十五条，税务机关对欠税的清偿顺序优先于普通债权。若公司财产不足清偿全部债务，税务机关可依法参与分配，确保税款优先受偿。

4. 对清算组的影响
   若清算组在清算过程中未依法履行税务申报义务，或协助公司隐匿、转移财产以逃避纳税，可能被追究行政责任或刑事责任。清算组成员需严格履行《公司法》规定的忠实义务，否则需对债权人或税务机关承担赔偿责任。

建议：若公司涉及清算，建议提前委托专业税务律师或会计师对税务合规性进行全面审查，主动补缴欠税并配合税务机关调查，以降低法律风险。如有具体案件或细节需进一步分析，可直接向我咨询。