在执行案件中，追加公司独资自然人（即一人有限责任公司的股东）作为被执行人的法律依据主要来源于《中华人民共和国公司法》及其相关司法解释，特别是针对一人有限责任公司股东责任承担的规定。以下从不同角度为您详细分析：

1. 法律依据的核心条款

• 《公司法》第六十三条：这是追加一人有限责任公司股东为被执行人的直接法律依据。该条款规定：“一人有限责任公司的股东不能证明公司财产独立于股东自己的财产的，应当对公司债务承担连带责任。”这意味着，在执行程序中，如果债权人能够证明或法院依职权查明一人有限责任公司的财产与股东个人财产混同，股东即需对公司债务承担连带责任，从而可以被追加为被执行人。

2. 执行程序中的具体操作

• 申请追加被执行人：在执行过程中，债权人（申请执行人）可以向执行法院提交书面申请，请求追加一人有限责任公司的股东为被执行人。申请时需提供初步证据证明公司财产与股东财产可能混同，如公司财务账目混乱、股东与公司之间频繁进行资金往来等。
• 法院审查与裁定：执行法院收到申请后，会进行审查。审查过程中，法院可能会要求股东提供证据证明公司财产独立于其个人财产。如果股东未能提供充分证据，或者提供的证据不足以证明财产独立，法院将裁定追加股东为被执行人。
• 异议与复议：股东对追加裁定不服的，可以在法定期限内提出执行异议。如果异议被驳回，股东还可以向上级法院申请复议。但复议期间不停止执行，除非法院另有裁定。

3. 实践中的注意事项

• 证据收集：债权人应尽可能收集能够证明公司财产与股东财产混同的证据，如公司银行账户流水、股东个人银行账户流水、公司财务报告、审计报告等。这些证据对于成功追加股东为被执行人至关重要。
• 法律程序：在申请追加被执行人时，债权人应严格遵守法律程序，按照法院的要求提交申请材料，并积极参与法院组织的听证会等程序。
• 风险防范：对于一人有限责任公司的股东而言，为避免被追加为被执行人，应建立健全的公司财务制度，确保公司财产与个人财产严格分离，并定期进行财务审计。

4. 特殊情况下的处理

• 股东已转让股权：如果股东在债务发生后已将其持有的公司股权转让给他人，且能够证明转让时公司财产与个人财产独立，则一般不应再被追加为被执行人。但若转让行为存在恶意逃避债务的情形，法院可能仍会裁定追加原股东为被执行人。
• 公司已注销：如果公司在债务发生后已注销，且股东未能证明公司注销时已依法进行清算并清偿了全部债务，债权人仍可申请追加股东为被执行人，要求其承担公司债务的清偿责任。

总结来说，追加一人有限责任公司股东为被执行人主要依据《公司法》第六十三条的规定，并需遵循执行程序中的相关操作规范。债权人在申请追加时应注重证据收集，股东则应加强风险防范意识，确保公司财产与个人财产的独立性。如果您在执行案件中遇到相关问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。