违章建筑无经营资质的酒店的经营损失一般不能认定。以下是详细分析：

首先，从法律角度来看，违章建筑是指未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的建筑物或构筑物。这类建筑在法律上是不被承认的，因此也无法获得合法的产权证明。对于无经营资质的酒店，意味着其并未按照相关法律法规的规定，办理合法的经营手续，因此其经营活动本身就不受法律保护。

其次，经营损失的认定通常需要在合法经营的前提下进行。在合法经营的情况下，如果因某种原因（如合同违约、侵权行为等）导致经营受损，那么受损方可以依法要求赔偿。然而，在违章建筑且无经营资质的情况下，酒店本身就不具备合法经营的基础，因此其所谓的“经营损失”也就无法得到法律的认可和保护。

最后，从实际操作层面来看，即便酒店试图通过法律途径来主张其经营损失，但由于其违章建筑和无经营资质的事实，法院在审理过程中也会对其主张持谨慎态度。在大多数情况下，法院可能会认为这类主张缺乏法律依据和事实基础，从而不予支持。

综上所述，违章建筑无经营资质的酒店的经营损失一般不能认定。因此，对于这类酒店而言，更重要的是尽快纠正其违章行为，办理合法的经营手续，以确保其经营活动的合法性和稳定性。如有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。