签订合同只盖合同专用章，在大多数情况下是有效的，但具体效力需结合合同内容、双方约定及法律规定综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 合同专用章的法律效力

• 根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同时，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这里的“盖章”包括合同专用章，只要合同内容合法、双方意思表示真实，并加盖了合同专用章，合同即具有法律效力。
• 合同专用章是企业为签订合同而专门刻制的印章，代表企业的签约意愿。因此，仅盖合同专用章通常足以表明企业认可合同内容，合同即告成立并生效。

2. 特殊情况下的效力限制

• 合同约定：如果合同中明确约定需要法定代表人或授权代表签字并盖章才有效，那么仅盖合同专用章可能不足以使合同生效。此时，应严格遵守合同约定，确保合同满足所有生效条件。
• 无权代理：若盖章的人没有得到公司的合法授权，擅自加盖合同专用章，合同的效力可能会受到影响。但若构成表见代理（即相对人有理由相信行为人有代理权），该代理行为仍然有效，合同对公司具有约束力。
• 法律、行政法规的特殊规定：对于某些特定类型的合同，如涉及土地使用权转让、企业合并分立等，法律、行政法规可能要求必须经过公证、鉴证、审批或登记等程序才能生效。在这种情况下，即使合同上盖有合同专用章，也需要完成相应的法定程序才能使合同具有法律效力。

3. 实践建议

• 审查合同条款：在签订合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于合同生效条件的约定，确保合同满足所有生效要求。
• 确认印章真实性：核实合同专用章的真实性、合法性和有效性，避免使用伪造、变造或被盗用的印章。
• 保留证据材料：合同签订后，应妥善保管合同原件及相关证据材料，如双方往来的函件、聊天记录、履行合同的相关凭证等。这些证据在日后可能出现的纠纷中将起到关键作用。
• 及时咨询：若对合同效力产生争议，或面临复杂的法律情境，可直接向我咨询，我会根据具体情况为您提供专业的法律意见和指导。

4. 法律后果

• 如果合同仅盖合同专用章且符合上述有效条件，则合同对双方具有约束力，任何一方违反合同约定均需承担相应的法律责任。
• 如果合同因未满足生效条件而无效，则双方可能无需履行合同义务，但需根据过错程度承担缔约过失责任等法律后果。

总结：签订合同只盖合同专用章在大多数情况下是有效的，但需注意合同约定、无权代理及法律、行政法规的特殊规定。为了确保合同的合法性和有效性，建议在签订合同时谨慎行事，并直接向我咨询相关法律问题。