针对“不是针对审查意见通知书所进行的修改是否可以接受”这一问题，结论并非绝对，而是需要依据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：
修改内容与审查意见通知书的关系：
- 如果修改的内容与审查意见通知书中的要求无直接关联，但修改本身并不违反法律法规、不损害公共利益、不侵犯他人合法权益，且符合行政机关的审批要求或标准，那么这种修改在理论上是有可能被接受的。然而，这并不意味着所有与审查意见通知书无关的修改都会被接受，因为行政机关在审批过程中还会考虑其他多种因素。
- 另一方面，如果修改的内容虽然与审查意见通知书无直接关联，但修改后导致项目或申请不符合法律法规、公共利益或他人合法权益的要求，或者违反了行政机关的审批规定或标准，那么这种修改显然是不会被接受的。
行政机关的自由裁量权：
- 行政机关在审批过程中享有一定的自由裁量权。这意味着，即使修改的内容与审查意见通知书无直接关联，行政机关也有可能根据具体情况、政策导向或公共利益的需要，决定是否接受这种修改。
- 因此，在提交修改时，建议尽量与审查意见通知书的要求保持一致，以减少行政机关的自由裁量空间，提高修改被接受的可能性。
实际操作中的建议：
- 明确修改目的：在提交修改前，应明确修改的目的和必要性，确保修改内容符合法律法规和行政机关的审批要求。
- 与行政机关沟通：如果修改内容与审查意见通知书无直接关联，建议提前与行政机关进行沟通，了解其对修改的看法和态度，以便更好地调整修改方案。
- 准备充分材料：在提交修改时，应准备充分的材料来支持修改的必要性和合理性，如相关法律法规、政策文件、专家意见等。
可能的法律后果：
- 如果修改未被接受，且申请人未按照审查意见通知书的要求进行修改或补充材料，行政机关可能会作出不予批准的决定。
- 在极端情况下，如果修改内容涉及违法违规行为，申请人还可能面临法律责任和处罚。
总结来说，不是针对审查意见通知书所进行的修改是否可以接受，取决于修改内容本身、行政机关的自由裁量权以及实际操作中的多种因素。因此，在提交修改前，建议申请人仔细研究审查意见通知书的要求，明确修改目的和必要性，并与行政机关进行充分沟通。如果遇到复杂的法律问题或不确定的情况，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。