结论：是否需要分别起诉暂扣三轮车和限制人身自由的行为，取决于这两个行为是否由同一主体实施、是否基于同一事实或法律关系，以及是否造成了不同的损害后果。以下从不同角度进行分析：

1. 同一主体实施且基于同一事实或法律关系

   • 如果暂扣三轮车和限制人身自由是由同一行政机关或执法人员基于同一违法行为（如无证驾驶、交通肇事等）而实施的，且这两个行为在法律上被视为同一行政处罚或行政强制措施的不同组成部分，那么通常不需要分别起诉。
   • 在这种情况下，受害人可以在一个行政诉讼中同时主张这两个行为的违法性，并要求法院一并审查并作出判决。例如，如果交警因你无证驾驶而暂扣了你的三轮车，并同时限制了你的人身自由（如拘留），你可以在一个行政诉讼中挑战这两个行为的合法性。

2. 不同主体实施或基于不同事实或法律关系

   • 如果暂扣三轮车和限制人身自由是由不同的主体（如一个行政机关暂扣三轮车，另一个行政机关或司法机关限制人身自由）实施的，或者虽然由同一主体实施但基于不同的事实或法律关系（如一个是因为交通违法，另一个是因为涉嫌犯罪），那么可能需要分别起诉。
   • 在这种情况下，由于两个行为在法律上被视为独立的，受害人需要分别针对每个行为提起行政诉讼或刑事诉讼（如果涉及刑事犯罪的话）。例如，如果交警暂扣了你的三轮车，而后来你因其他犯罪行为被公安机关拘留，这两个行为就需要分别通过不同的法律程序来挑战。

3. 造成了不同的损害后果

   • 即使暂扣三轮车和限制人身自由是由同一主体实施且基于同一事实或法律关系，但如果它们造成了不同的损害后果（如三轮车被暂扣导致的财产损失和人身自由被限制导致的精神损害），受害人也可以选择分别起诉以寻求不同的赔偿。
   • 在这种情况下，虽然可以在一个诉讼中同时主张多个损害后果，但为了更清晰地展示每个损害后果与对应行为之间的因果关系，以及更精确地计算每个损害后果的赔偿金额，分别起诉可能更为合适。

法律建议：

• 在决定是否分别起诉时，建议你首先仔细分析两个行为之间的关系以及它们所造成的损害后果。
• 如果两个行为紧密相关且造成了相似的损害后果，考虑在一个诉讼中同时主张；如果两个行为相对独立或造成了不同的损害后果，则可能需要分别起诉。
• 无论选择哪种方式，都建议你及时咨询专业律师（在这里就是我啦，程全中律师，专注于交通事故、合同纠纷领域），以便更准确地评估你的法律权益和制定合适的诉讼策略。

可能法律后果：

• 如果选择在一个诉讼中同时主张两个行为的违法性，法院将一并审查并作出判决。如果判决支持你的主张，你将获得相应的赔偿或救济。
• 如果选择分别起诉，你需要为每个诉讼准备相应的证据和材料，并分别承担诉讼费用和风险。然而，这也可能为你提供更精确的赔偿和更清晰的法律责任划分。