若公司注册资金被恶意减少，股东或相关权益人可以采取以下措施来维护自身权益：

一、法律背景与恶意减少注册资金的认定

首先，我们需要明确“恶意减少注册资金”的法律含义。在公司法中，注册资金是公司对外承担债务责任的基础，其变动需遵循严格的法律程序。恶意减少注册资金，通常指的是公司股东或管理层通过不正当手段，如虚构债务、抽逃资金等，故意降低公司注册资金，以逃避债务或损害其他股东、债权人的利益。

二、应对措施

1. 内部救济途径

   • 股东会决议撤销或无效之诉：如果恶意减少注册资金的行为是通过股东会决议实现的，且该决议存在违法或违反公司章程的情形，其他股东可以提起股东会决议撤销或无效之诉，要求法院撤销或宣告该决议无效。
   • 损害赔偿之诉：股东或债权人因恶意减少注册资金行为受到损害的，可以向法院提起损害赔偿之诉，要求责任方赔偿损失。

2. 外部监管途径

   • 向工商行政管理部门举报：工商行政管理部门是公司注册资金的监管主体，对于恶意减少注册资金的行为，股东或相关权益人可以向其举报，要求其对公司进行调查，并依法进行处罚。
   • 申请法院强制清算或破产：如果恶意减少注册资金导致公司无法清偿到期债务，且明显缺乏清偿能力，债权人可以向法院申请对公司进行强制清算或破产，以维护自身权益。

3. 刑事责任追究

   • 抽逃出资罪：如果股东通过虚构债务、转移资产等方式抽逃出资，数额巨大、后果严重或者有其他严重情节的，可能构成抽逃出资罪，依法应追究刑事责任。
   • 其他犯罪行为：如恶意减少注册资金过程中涉及伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章，或者妨害清算等犯罪行为的，也应依法追究刑事责任。

三、具体操作建议

1. 收集证据：股东或相关权益人应首先收集恶意减少注册资金的相关证据，如公司财务报表、银行转账记录、股东会决议等，以证明恶意减少注册资金的事实。
2. 咨询专业律师：在采取法律行动前，建议咨询专业律师，了解具体法律程序和可能面临的法律风险，以便制定合适的维权策略。
3. 及时采取行动：一旦发现恶意减少注册资金的行为，应及时采取行动，避免损失扩大。同时，要注意法律程序的时效性，确保在法定期限内提起诉讼或申请。

四、法律后果

恶意减少注册资金的行为不仅可能面临民事赔偿和行政处罚，还可能构成犯罪，依法应追究刑事责任。因此，公司股东和管理层应严格遵守公司法规定，不得恶意减少注册资金，以维护公司、股东和债权人的合法权益。

若您遇到公司注册资金被恶意减少的情况，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议和维权方案。