结论：原法定代表人与公司有协议约定使用原公章处理遗留债务，这一行为是否违法，需结合具体情况判断，若协议合法有效且符合公司章程与法律规定，则使用原公章不违法；反之，若协议存在瑕疵或违反法律规定，则可能构成违法。以下从不同角度详细分析：
一、协议合法有效的前提
协议内容合法：
- 协议需明确双方的权利义务，特别是关于使用原公章处理遗留债务的具体范围、方式、期限等。
- 协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。
协议签订程序合法：
- 协议需经公司合法授权的代表（如现任法定代表人或董事会）签署，或经过公司股东会、董事会的合法决议程序。
- 若原法定代表人未经合法授权擅自签订协议，则协议可能因缺乏合法性而无效。
公司章程与法律规定：
- 需检查公司章程是否对公章的使用、遗留债务的处理等有特别规定。若公司章程有明确规定，则协议内容需与之相符。
- 同时，需遵守《公司法》、《合同法》等相关法律法规的规定，确保协议内容合法合规。
二、使用原公章的合法性
公章的效力：
- 公章是公司对外表示意思的重要工具，具有法律效力。但公章的效力取决于其使用是否合法、合规。
- 若原公章已被公司声明作废或注销，则使用该公章签订的协议可能无效。
使用原公章的合法情形：
- 若协议合法有效，且公司同意或授权原法定代表人使用原公章处理遗留债务，则使用原公章是合法的。
- 在此情况下，原法定代表人的行为代表公司，其法律后果由公司承担。
使用原公章的违法情形：
- 若协议存在瑕疵或违反法律规定，或原法定代表人未经公司同意擅自使用原公章，则可能构成违法。
- 违法使用公章可能导致协议无效，原法定代表人可能需承担个人责任，如赔偿损失、承担违约责任等。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 若使用原公章违法，公司可能面临合同无效、债务无法清偿等法律风险。
- 原法定代表人可能因违法使用公章而承担个人责任，包括民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。
建议：
- 在处理遗留债务时，公司应谨慎评估协议内容与签订程序的合法性。
- 若需使用原公章，应确保公司同意或授权，并办理相关手续（如出具授权委托书、公告公章变更等）。
- 若对协议内容或公章使用有疑问，建议咨询专业律师以规避法律风险。
示例：假设某公司因业务调整需处理一批遗留债务，原法定代表人与公司签订协议约定使用原公章处理这些债务。若该协议经公司董事会合法决议通过，且公司章程未对公章使用有特别限制，则原法定代表人使用原公章处理遗留债务是合法的。反之，若协议未经合法授权或违反公司章程规定，则使用原公章可能构成违法。
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