巨额财产来源不明罪的认定主要依据以下几个方面：
主体要件：
- 巨额财产来源不明罪的主体特定为国家工作人员。这包括在国家机关、国有公司、企业、事业单位、人民团体中从事公务的人员，以及被委派到非国有单位从事公务的人员等。只有具备这一特定身份的人员，才可能构成此罪。
客观要件：
- 财产、支出明显超过合法收入，差额巨大：这是认定巨额财产来源不明罪的核心要素。行为人的财产和支出必须明显超过其合法收入，且差额部分达到“巨大”标准。根据相关司法解释，通常认为差额在30万元以上即为“差额巨大”。这里的“财产”指实际拥有的全部财产，“支出”指已实际支付的款物，“合法收入”则包括工资、奖金、继承遗产等法律允许的收入。
- 不能说明来源：行为人需经司法机关责令后，仍无法说明或拒绝说明其财产与合法收入之间巨大差额的来源。这包括拒不说明、无法具体说明、虚假说明以及虽说明但无法查实且排除合法可能性的情况。
主观要件：
- 本罪在主观上表现为故意，即行为人明知自己的财产或支出明显超过合法收入，且在被责令说明来源时，故意拒绝说明或作虚假说明。这种故意体现了行为人对侵犯公民私人所有财产危害结果的明知和放任态度。
在认定巨额财产来源不明罪时，还需注意以下几点：
- 差额部分的计算：差额部分是指行为人的财产和支出与其合法收入之间的差额。在计算时，应全面考虑行为人的所有财产和支出，以及其合法收入的所有来源。
- 不能说明来源的认定：不能说明来源不仅指行为人拒不说明或无法具体说明，还包括虚假说明以及虽提供线索但司法机关无法查实且能排除合法性的情况。这要求司法机关在调查过程中要全面、细致地收集证据，确保认定的准确性。
- 与其他罪名的区分：在认定巨额财产来源不明罪时，还需注意与其他罪名如贪污罪、受贿罪等的区分。如果行为人的财产差额部分是通过贪污、受贿等犯罪行为所得，则应按照相应的罪名进行数罪并罚。
关于巨额财产来源不明罪的处罚：
根据《中华人民共和国刑法》第三百九十五条第一款的规定，犯巨额财产来源不明罪的，处五年以下有期徒刑或者拘役；差额特别巨大的，处五年以上十年以下有期徒刑。同时，财产的差额部分将被依法追缴。这一处罚旨在维护国家工作人员的廉洁形象，保护公私财物的合法权益。
举例说明：
假设某国家工作人员A，其经司法机关认定财产和支出明显超过合法收入，差额达50万元，且不能说明来源。那么，A将可能因巨额财产来源不明罪被判处五年以下有期徒刑或拘役，并且其50万元的差额部分将被依法追缴。
总结与建议：
巨额财产来源不明罪是一项针对国家工作人员的特殊罪名，其认定需综合考虑主体、客体、客观及主观要件。对于国家工作人员而言，应时刻保持警惕，确保自身财产状况的合法性与透明度，避免触碰法律红线。如果面临相关指控或疑问，建议及时向我咨询，以便获得专业的法律帮助。