当法院执行案款被保全后，案件的处理需要遵循一系列法定流程，以确保申请人的合法权益得到有效保障。以下是对该问题的详细解答：
一、启动执行程序
申请或移送执行：
- 在保全裁定作出后，如果被申请人未按照裁定要求履行义务，申请人需要在法定期限内向法院提出执行申请。
- 对于某些特定类型的案件，如追索赡养费、扶养费等，法院可能会依职权直接移送执行，无需申请人再次申请。
立案审查：
- 执行机构在收到执行申请后，会进行立案审查，主要核实申请材料的完整性和合法性。
- 如果申请符合立案条件，执行机构会予以立案；如果不符合，会通知申请人补充材料或驳回申请。
二、执行实施阶段
发出执行通知：
- 执行机构会向被执行人发出执行通知书，责令其在指定期限内履行义务。
- 如果被执行人逾期不履行，执行机构将采取强制执行措施。
财产调查与控制：
- 执行机构会通过网络查控系统查询被执行人的银行存款、房产、车辆等财产信息。
- 对发现的财产，执行机构会采取查封、扣押、冻结等措施，以防止被执行人转移或隐匿财产。
强制执行措施：
- 根据案件具体情况，执行机构可以采取拍卖、变卖财产、划拨存款、扣留收入等强制措施。
- 对于拒不履行义务的被执行人，执行机构还可以依法采取罚款、拘留等处罚措施。
参与分配与优先受偿：
- 如果被执行人的财产不足以清偿全部债务，且存在多个债权人申请执行的情况，执行机构会按照法定顺序进行参与分配。
- 在这种情况下，已采取保全措施的债权人在分配中通常享有优先受偿权，但具体需根据法律规定和案件情况确定。
三、执行异议与处理
提出异议：
- 被执行人或案外人对执行行为或执行标的提出书面异议的，执行机构应进行审查。
异议处理：
- 如果异议理由成立，执行机构会裁定撤销或改正执行行为；如果异议理由不成立，会裁定驳回。
- 如果案外人对执行标的主张实体权利，他们可以通过案外人异议之诉等途径解决争议。
四、执行结案与后续事项
执行完毕：
- 如果被执行人履行完毕义务或执行和解协议约定内容，执行案件会以“执行完毕”方式结案。
终结本次执行程序：
- 如果执行机构经穷尽财产调查措施未发现可供执行财产，可以裁定终结本次执行程序。
- 在这种情况下，如果发现新的财产线索，执行案件可以恢复执行。
后续救济途径：
- 如果当事人对执行裁定不服，他们可以在法定期限内向上级法院申请复议或提起执行异议之诉。
综上所述，当法院执行案款被保全后，案件的处理需要遵循一系列法定流程。申请人应积极配合执行机构的工作，提供必要的证据和信息，以便执行机构能够顺利推进案件的执行进程。同时，如果申请人对执行过程或结果有任何疑问或不满，他们可以通过合法途径提出异议或申请复议。