民事公益诉讼与行政公益诉讼在程序上存在多方面的显著区别，主要体现在以下几个方面：
一、原告主体与起诉条件
民事公益诉讼：
- 原告主体：法律规定的机关（如环保部门在特定情境下）和有关组织（如消费者权益保护组织、环保组织等）是主要的原告。此外，人民检察院在特定情况下，如无其他适格原告或支持起诉时，也可提起诉讼。
- 起诉条件：不以实际损害为绝对前提，潜在危害也可成为起诉的理由。例如，在环境污染案件中，即使损害尚未实际发生，但只要有证据表明存在潜在的危害，即可提起诉讼。
行政公益诉讼：
- 原告主体：主要为人民检察院，负责监督行政机关依法行使职权。
- 起诉条件：人民检察院在履行职责中发现行政机关违法行使职权或不作为，且该行为可能或已经损害国家利益或社会公共利益时，方可提起诉讼。起诉前，人民检察院通常需先向行政机关提出检察建议，督促其依法履行职责。
二、被告类型与诉讼对象
民事公益诉讼：
- 被告类型：通常是实施了损害社会公共利益行为的公民、法人或其他组织，如污染企业、侵权商家等。
- 诉讼对象：主要针对平等主体之间的民事侵权行为，如环境污染、侵害消费者合法权益等。
行政公益诉讼：
- 被告类型：是负有监督管理职责但违法行使职权或不作为的行政机关，以及法律、法规、规章授权的组织。
- 诉讼对象：主要针对行政机关的违法行政行为或不作为，集中在生态环境和资源保护、食品药品安全、国有财产保护等特定领域。
三、诉前程序与举证责任
民事公益诉讼：
- 诉前程序：法律规定的机关和有关组织提起诉讼前，通常需要先进行公告，催促适格主体提起诉讼。只有在没有其他适格主体提起诉讼的情况下，才能向法院起诉。
- 举证责任：原告需对被告的损害行为、损害后果及因果关系承担举证责任。在特殊侵权领域，如环境污染，可能实行举证责任倒置，即由被告承担举证责任。
行政公益诉讼：
- 诉前程序：人民检察院在提起诉讼前，必须先向行政机关提出检察建议，这是必经程序。行政机关应当在收到检察建议书之日起一定期限内依法履行职责，并书面回复人民检察院。
- 举证责任：行政机关对其行政行为的合法性负有举证责任。人民检察院需证明行政机关存在违法行为或不作为，以及公共利益受损的事实。
四、诉讼请求与判决类型
民事公益诉讼：
- 诉讼请求：原告可以提出停止侵害、排除妨碍、消除危险、恢复原状、赔偿损失等诉讼请求。
- 判决类型：法院根据原告的诉讼请求和案件事实，作出相应的判决，如判令被告停止侵害行为、赔偿损失等。
行政公益诉讼：
- 诉讼请求：人民检察院可以向人民法院提出撤销或部分撤销违法行政行为、在一定期限内履行法定职责、确认行政行为违法或无效等诉讼请求。
- 判决类型：法院根据人民检察院的诉讼请求和案件事实，作出相应的判决，如撤销违法的行政行为、责令行政机关履行法定职责等。
五、判决执行与法律后果
民事公益诉讼：
- 判决执行：若被告不履行判决，原告可申请强制执行。执行内容围绕被告的民事责任，如停止侵害、赔偿损失等。
- 法律后果：被告需承担民事责任，可能面临罚款、赔偿等法律后果。
行政公益诉讼：
- 判决执行：若行政机关不履行判决，法院可采取多种执行措施，包括划拨罚款、赔偿金等，甚至可能对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分。
- 法律后果：行政机关需承担行政责任，可能面临被撤销或变更行政行为、被责令履行职责等法律后果。同时，相关责任人员也可能受到行政处分或法律追究。
总结与建议：
民事公益诉讼与行政公益诉讼在程序上存在多方面的区别，这些区别体现了两者在保护公共利益方面的不同侧重点和方式。在实际应用中，应根据具体案件情况和法律规定选择合适的诉讼类型。如果你面临相关法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我将根据你的具体情况提供详细的法律建议。