总公司委托分公司收款在合法合规的前提下是合法的。以下从多个角度为您详细分析：
一、法律基础与分公司地位
根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，分公司是总公司的分支机构，不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。这意味着，分公司作为总公司的附属机构，在总公司的授权范围内，可以从事一定的业务活动，包括收款。因此，从法律基础来看，总公司委托分公司收款是具备合法性的前提的。
二、合法委托的关键要素
书面授权：
- 总公司必须向分公司出具书面授权文件，明确允许其代总公司进行收款业务。
- 授权文件应详细列明代收款的范围、额度、期限等关键事项，以确保代收款行为在授权范围内进行。
通知交易相对方：
- 总公司应将委托分公司收款的事宜及时、明确地通知交易相对方，建议采用正式的书面函件形式。
- 交易相对方在收到通知后，应进行确认回复，以表明其已知悉并接受该委托安排，这有助于巩固委托关系的法律效力。
财务管理与款项交接：
- 总公司和分公司应建立完善的财务管理和款项交接制度，确保代收款项能够准确、及时地进入相应账户，并做好账目记录。
- 分公司应以总公司的名义开具发票（如涉及开票），以确保税务处理的合规性。
三、实际操作中的注意事项
确保业务真实性：
- 分公司代收款必须基于真实发生的业务，不能虚构或夸大业务内容。
- 应保留好相关业务合同、资金往来凭证等资料，以证明业务的真实性。
避免税务风险：
- 代收款行为必须符合税收法规，不能利用代收款来逃避纳税义务或进行其他税务违法行为。
- 分公司应准确核算代收款项对应的税费，并按时申报缴纳。
明确法律责任：
- 在委托收款关系中，如因分公司的不当行为导致损失或纠纷，总公司作为委托方应承担相应的法律责任。
- 同时，总公司也有权根据委托协议的约定，向分公司追究相应的责任。
四、可能面临的法律后果
如果总公司未按照上述要求合法委托分公司收款，或者分公司超出授权范围进行收款，可能会面临以下法律后果：
- 民事纠纷：如交易相对方对资金流向产生疑虑，可能引发经济纠纷。
- 行政处罚：如税务机关发现通过代收款隐瞒收入逃避纳税，可能责令补缴税款、加收滞纳金并给予罚款等处罚。
- 刑事责任：在极端情况下，如果代收款行为涉及诈骗、洗钱等违法犯罪活动，相关责任人可能面临刑事追究。
五、建议与总结
为了确保总公司委托分公司收款的合法性和规范性，我建议您：
- 签订书面委托协议：明确双方的权利义务和委托收款的具体事项。
- 及时通知交易相对方：确保交易相对方知晓并接受该委托安排。
- 建立完善的财务管理制度：确保代收款项的准确、及时入账和合规开票。
- 咨询专业法律意见：在涉及复杂业务或法律风险较高的情况下，及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
如果您在总公司委托分公司收款的过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。