核心结论：业主平行发包单位的资料是否由总包归档，需分情况讨论，具体如下：

1. 合同有明确约定时
   若总包合同或平行发包合同中明确约定“平行发包单位的资料由总包统一归档”，则总包需承担归档义务。此时，业主可依据合同条款要求总包履行责任，若总包未履行，可能构成违约，需承担继续履行、赔偿损失等责任。
   法律依据：根据《民法典》第509条，当事人应按约定全面履行义务；第577条，违约方需承担违约责任。

2. 合同无明确约定时
   若合同未约定归档主体，需结合行业惯例和实际履行情况判断：

   • 行业惯例：建筑行业通常默认总包对工程资料负有统筹管理义务（如《建设工程文件归档规范》GB/T50328-2014要求总包汇总分包资料），但平行发包单位若独立与业主签约，其资料可能不纳入总包范围。
     
   • 实际履行：若总包实际参与了平行发包单位资料的收集、整理（如提供统一格式、协助盖章等），可能被认定为“事实归档行为”，业主可据此主张总包承担责任。
     建议：此时业主与总包应通过补充协议明确责任，避免纠纷。

3. 业主直接要求总包归档时
   即使合同无约定，若业主以“便于工程整体管理”为由要求总包归档，总包可拒绝，但需注意：

   • 若总包未拒绝且实际履行了归档行为（如接收资料、整理成册），可能被认定为“自愿承担义务”，后续不得以“无合同约定”为由反悔。
     
   • 若总包明确拒绝，业主不得强制要求，否则可能构成对总包经营自主权的干涉。
     风险提示：总包若接受业主要求，建议留存书面确认文件（如邮件、会议纪要），避免口头约定导致举证困难。

实务建议：

• 对业主：在平行发包合同中明确约定资料归档主体（如“各平行发包单位自行归档，总包仅配合提供必要协助”），避免责任推诿。
  
• 对总包：若合同未约定归档义务，收到业主或平行发包单位资料时，应书面回复“仅代为保管，不承担归档责任”，并留存送达证据。
  

如有具体合同条款或纠纷场景，可进一步向我咨询，我会结合细节提供针对性分析。