可以申请查封门窗公司的设备及材料，但需满足一定条件并遵循法定程序。具体分析如下：

1. 法律依据与执行原则
   根据《民事诉讼法》第249条，被执行人未按执行通知履行义务时，法院有权查封、扣押、拍卖其财产。执行的核心原则是“被执行人财产不足以清偿债务时，应执行其可供执行的财产”。即使公司账户无钱，只要其设备、材料属于合法财产且非法律豁免范围（如必要生产工具），均可成为执行对象。

2. 设备与材料的可执行性判断

   • 所有权确认：需证明设备/材料归被执行人所有（如通过工商登记、采购合同等）。若设备为租赁或抵押物，需先解决权属争议。
     
   • 必要性审查：法院会评估查封是否影响公司基本经营。若设备是维持生产的必需品，可能采取“活封”措施（允许使用但禁止处分），或要求被执行人提供其他担保后解封。
     
   • 价值匹配原则：查封财产价值应与债务金额相当，避免超标的查封。

3. 申请流程与注意事项

   • 提交书面申请：向执行法院提交《查封申请书》，附债务凭证（如判决书）、财产线索（如设备清单、存放地点）及被执行人经营状况证明。
     
   • 法院审查与执行：法院审查后作出裁定，并由执行员实施查封。查封后，法院可能委托评估机构拍卖财产，或促成双方和解（如以物抵债）。
     
   • 异议处理：若被执行人或案外人提出异议（如主张设备所有权），法院将举行听证会审查，异议成立则中止执行。

4. 实践中的风险与应对

   • 隐匿财产风险：若公司通过转移设备、虚构债务等方式逃避执行，可申请法院调查其财务记录，或依据《刑法》第313条追究拒不执行判决罪。
     
   • 执行效率问题：若设备变现困难（如专用设备市场狭小），可与法院沟通，尝试通过分期履行、租金收益执行等替代方案。

建议行动步骤：

1. 收集设备/材料的权属证明及价值证据；
   
2. 向执行法院提交查封申请，并同步申请调查被执行人财产状况；
   
3. 关注查封后的财产处置进展，必要时申请参与分配或提出异议。
   

如有进一步细节（如设备是否抵押、公司股权结构等），可补充说明后为您定制方案。