在合同纠纷案件中，如果法院开庭时被告人缺席，法院会依据相关法律法规和诉讼程序来处理这一情况，以确保诉讼的顺利进行和双方当事人的合法权益得到保障。以下是对此问题的详细解答：
一、法院的处理方式
依法审理与缺席判决：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，如果被告经传票传唤，无正当理由拒不到庭，或者未经法庭许可中途退庭，法院有权进行缺席判决。
- 法院会按照法定程序进行审理，包括审查原告提供的证据材料、听取原告的陈述和辩论意见等。
严格核实证据：
- 法院会对原告提交的证据进行严格审查，确保其真实性、合法性和关联性。
- 如果原告提供的证据足以证明其主张的事实，法院将依据这些证据作出判决。
公告送达与强制执行：
- 如果被告下落不明或无法直接送达判决书，法院可能会采用公告送达的方式。
- 判决生效后，如果被告不履行判决义务，原告可以向法院申请强制执行，通过查封、扣押、拍卖财产等方式实现债权。
二、被告缺席的可能后果
丧失答辩机会：
- 被告缺席庭审意味着放弃了当庭陈述、举证质证和辩论的权利，这可能导致法院无法全面了解案件事实。
承担不利后果：
- 由于被告未出庭抗辩，法院可能更倾向于采信原告的主张和证据，从而作出对被告不利的判决。例如，在货物买卖合同纠纷中，如果原告主张被告未按约定支付货款并提供充分证据，被告未到庭则法院可能缺席判决其支付货款及违约金。
影响信用记录：
- 如果被告败诉后拒不履行判决义务，将被纳入失信被执行人名单，这会影响其个人或企业的信用记录和经营活动。
三、对当事人的建议
对于原告：
- 在起诉前应尽可能收集并整理好所有与案件相关的证据材料，确保能够充分证明自己的主张。
- 明确列出自己的诉讼请求，包括要求支付的金额、违约金数额以及承担诉讼费用等。
- 密切关注案件的进展情况和法院的通知要求，及时参加庭审并遵守法庭纪律。
对于被告：
- 如果因正当理由无法到庭，应及时向法院提出延期开庭申请并提供相应证明材料。
- 即使无法到庭，也应通过合法途径了解案件进展，并在规定期限内对法院判决提出异议或上诉，以维护自己的合法权益。
四、总结
被告缺席庭审并不影响法院对合同纠纷案件的审理和判决。法院会依据法律规定和具体案件情况，在保障双方当事人合法权益的基础上作出公正裁决。因此，作为当事人，最好还是按传票上的时间和地点准时出庭，以免对自己的合法权益造成不利影响。如果确实无法到庭，应及时与法院沟通并寻求合法解决方案。