公司申请工伤认定时，一般不需要直接上传工资流水，但工资流水在后续工伤赔偿阶段可能作为重要证据使用。以下从不同角度为你详细分析：

一、工伤认定阶段

在申请工伤认定时，主要需要提交的是能够证明劳动关系、事故发生时间、地点及原因的相关材料。根据《工伤保险条例》第十八条的规定，提出工伤认定申请应当提交下列材料：

1. 工伤认定申请表；
2. 与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料；
3. 医疗诊断证明或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。

工资流水并不属于上述必须提交的材料。工资流水主要用于证明劳动者的收入水平，在工伤认定阶段，主要关注的是是否存在劳动关系以及是否因工作原因受到伤害，而不是劳动者的具体收入。

二、工伤赔偿阶段

虽然工资流水在工伤认定阶段不是必须材料，但在后续的工伤赔偿阶段，工资流水却可能成为计算赔偿金额的重要依据。根据《工伤保险条例》及相关规定，工伤赔偿包括医疗费、停工留薪期工资、一次性伤残补助金等多项内容，其中停工留薪期工资和一次性伤残补助金的计算往往与劳动者的工资水平密切相关。

1. 停工留薪期工资：在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”通常指的是劳动者受伤前的平均工资水平，而工资流水可以作为证明这一水平的重要依据。
2. 一次性伤残补助金：一次性伤残补助金是根据劳动者的伤残等级和本人工资来计算的。本人工资是指工伤职工因工作遭受事故伤害或者患职业病前12个月平均月缴费工资。在计算这一金额时，工资流水同样可以作为重要参考。

三、建议与注意事项

1. 保留工资流水：尽管在工伤认定阶段不需要提交工资流水，但为了后续可能的赔偿计算，建议你妥善保留受伤前一段时间的工资流水记录。
2. 及时申请工伤认定：一旦发生工伤事故，应尽快向用人单位提出工伤认定申请，并按照要求提交相关材料。如果用人单位未在规定时间内提出申请，劳动者或其近亲属也可以直接向社会保险行政部门提出申请。
3. 咨询专业律师：如果在工伤认定或赔偿过程中遇到任何问题或疑问，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。

希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他关于工伤认定和赔偿的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。