关于您提出的“村书记注册多个公司是否合法”的问题，这需要从多个方面来综合考量。
首先，从法律层面来看，村书记作为公民，是有权利注册公司的。根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，只要满足一定的条件，如股东符合法定人数、有全体股东认缴的出资额、制定公司章程、有公司名称和组织机构、有公司住所等，任何人都可以注册公司。同时，《中华人民共和国村民委员会组织法》也并未明确禁止村书记拥有自己的公司。
然而，村书记注册公司并非毫无限制，在注册及经营过程中，村书记需要严格遵守相关法律法规，并确保不违反村集体的规章制度和村规民约。具体来说，有以下几点需要特别注意：
村集体相关限制：村书记在注册公司时，应仔细审查所在村集体的规章制度、村规民约等，看是否存在对村干部从事商业经营活动的特别规定。如果存在禁止或限制村书记注册与村集体利益有冲突公司的条款，那么村书记就需要遵守这些规定，避免违规操作。
廉洁纪律要求：村书记作为村干部，在经商办企业过程中，必须严格遵守党纪政纪和廉洁自律要求。不得利用职务便利为公司谋取不正当利益，防止权力寻租等违法行为的发生。这是维护村务工作公正性和村民信任的关键。
时间管理：村书记需要合理安排时间，确保不因个人公司事务而长时间脱离村务工作。村务工作的正常开展对于村民的生活和村庄的发展至关重要，村书记作为村务工作的负责人，必须确保有足够的时间和精力投入到村务工作中。
信息公开与透明：为了增强村民的信任和理解，村书记应将注册公司的情况向村民公开。说明公司经营业务与村务之间不存在利益冲突，确保整个过程的透明度和公正性。这有助于维护村务工作的正常秩序和村民的合法权益。
避免利益冲突：村书记在经营公司时，应严格区分公司事务与村务。不得利用职务之便为公司谋取不当利益，也不得让公司业务干扰到村务的正常进行。这是维护村务工作公正性和村民利益的重要保障。
至于村书记注册多个公司是否合法，关键在于是否满足上述条件，并确保所有公司的注册和经营行为都符合相关法律法规和村规民约。如果村书记能够妥善平衡村务工作与公司经营之间的关系，避免利益冲突，并严格遵守相关法律法规和村规民约，那么注册多个公司并不违法。
综上所述，村书记注册多个公司并非绝对合法或非法，而是需要根据具体情况来判断。在注册和经营过程中，村书记需要全面了解和遵守相关法律法规及村规民约，确保行为的合法性和合规性。同时，通过信息公开、避免利益冲突等措施，维护村务工作的正常秩序和村民的合法权益。