结论前置：
- 借条超过两年（或三年，当前法律规定的诉讼时效期间）仍然可以起诉，但胜诉权可能受到影响。若债务人以诉讼时效期间届满为由抗辩，且不存在诉讼时效中断、中止或延长情形，法院可能不会支持债权人的诉讼请求。
- 借条本身不会因时间流逝而失效，它仍然是证明债权债务关系的重要法律文件。
详细分析：
一、诉讼时效的规定与起诉权
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年（注：用户问题中提及“两年”，但现行法律已修改为三年，此处以现行法律为准）。这一规定并不影响债权人的起诉权，即债权人仍有权向法院提交起诉状和相关证据，启动诉讼程序。然而，如果债权在三年内未得到主张，且不存在诉讼时效中断或中止的情形，债务人可以提出诉讼时效抗辩，法院也可能因此驳回债权人的诉讼请求。
二、诉讼时效的起算与中断、中止
诉讼时效的起算：
- 若借条中约定了还款日期，则从还款日期的次日起算三年诉讼时效。
- 若借条未约定还款日期或约定不明确，则通常从债权人要求还款而债务人拒绝还款的次日起算。
诉讼时效的中断：
- 根据《民法典》第一百九十五条，权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或者申请仲裁等情形，均会导致诉讼时效中断，从中断时起，诉讼时效期间重新计算。例如，债权人在借条出具后的两年半时向债务人催要过欠款，诉讼时效就会从此时重新开始计算三年。
诉讼时效的中止：
- 依据《民法典》第一百九十四条，在诉讼时效期间的最后六个月内，因不可抗力、无民事行为能力人或限制民事行为能力人没有法定代理人等特定障碍导致权利人不能行使请求权的，诉讼时效中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。
三、法院受理条件与实体权利保障
依据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十二条的规定，只要起诉符合以下条件，法院就应当受理：
- 原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
- 有明确的被告；
- 有具体的诉讼请求和事实、理由；
- 属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
满足上述条件的案件，即使借条超过三年，法院也会受理。进入诉讼程序后，若被告未以诉讼时效已过进行抗辩，法院不会主动适用诉讼时效规定进行裁判，债权人仍有可能通过法院判决实现债权。
四、实际操作建议
- 及时主张权利：债权人应在诉讼时效期间内及时主张权利，避免因诉讼时效问题给自己带来不利影响。
- 保留证据：保留所有与债务相关的证据，如聊天记录、催款函、转账记录等，以备不时之需。这些证据在诉讼中可能起到关键作用，证明诉讼时效的中断或中止，或者证明债务人确实存在欠款事实。
- 咨询律师：如果你对诉讼时效或借条的有效性有疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供详细的法律分析和建议。
总结与提醒：
借条超过两年（或三年）仍然可以起诉，但胜诉权可能受到影响。为了避免不必要的法律风险，建议你及时主张权利，并保留好相关证据。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。