小额批量代发工资本身并不违法，但具体是否合法需结合实际情况来判断。以下从不同角度为你详细分析：
合法情形：
- 合规操作：如果公司通过银行或其他合法金融机构，按照劳动合同约定的时间和金额，以小额批量代发的方式向员工支付工资，且确保工资支付记录清晰、完整，这种操作是合法的。它实际上是一种便捷的工资支付方式，有助于提高支付效率，减少人为错误。
- 税务合规：在代发工资的过程中，公司需确保依法代扣代缴员工的个人所得税，并按时向税务机关申报缴纳。只要税务处理合规，小额批量代发工资就不会因税务问题而违法。
可能违法的情形：
- 未签订劳动合同或未约定工资支付方式：如果公司未与员工签订劳动合同，或劳动合同中未明确约定工资支付方式，而公司擅自采用小额批量代发的方式支付工资，且员工对此提出异议，这种操作可能因违反劳动合同法而面临法律风险。
- 拖欠或克扣工资：无论采用何种支付方式，如果公司存在拖欠或克扣员工工资的行为，都是违法的。小额批量代发工资并不能成为公司逃避支付工资责任的借口。
- 未依法代扣代缴个人所得税：如果公司在代发工资的过程中，未依法代扣代缴员工的个人所得税，或未按时向税务机关申报缴纳，这种操作将因违反税法而面临法律制裁。
法律建议：
- 完善合同条款：公司在与员工签订劳动合同时，应明确约定工资支付方式、时间、金额等关键条款，以避免因合同条款不明确而引发的法律纠纷。
- 确保税务合规：公司应依法代扣代缴员工的个人所得税，并按时向税务机关申报缴纳，以确保税务处理的合规性。
- 保留支付记录：公司应妥善保留工资支付记录，包括支付时间、金额、支付方式等信息，以备员工查询或法律需要。
总结来说，小额批量代发工资本身并不违法，但公司需确保操作合规、税务处理得当，并保留完整的支付记录。如果你在工资福利方面遇到任何问题，或有其他劳动工伤相关的法律疑问，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。