第三方代发工资本身并不直接违法，但其合法性取决于多个因素，包括是否存在合法有效的委托关系、是否遵守了相关税务、社保及劳动法规定，以及是否涉及逃避监管、税务违规或洗钱等非法活动。以下是对此问题的详细分析：
合法情形
存在合法委托协议：
- 当两家公司之间签订了合法有效的委托代发工资协议，明确双方的权利和义务时，代发工资属于正常的商业合作行为。例如，集团公司内部为统一财务管理而进行的代发工资操作，或者小微企业因财务人员不足而委托信任的第三方机构代发工资，只要按照企业提供的工资表准确发放，并正常申报纳税，就不涉及违法问题。
符合劳动法规和税务规定：
- 代发工资过程中应严格遵守劳动法律法规和税务规定，确保准确核算工资数额，并依法代扣代缴员工的个人所得税、社会保险费等。正规的人力资源服务公司接受企业委托代发工资时，需按国家规定为员工足额缴纳社保和代扣个税，这种行为是合法的。
特定关系下的合理代发：
- 在特殊的亲属或朋友关系中，若员工因特殊原因（如长期在国外）无法直接接收工资，委托亲属或朋友代为接收并转交，这种代发行为在不涉及逃税、洗钱等非法目的的情况下，通常是合法的。
可能存在的违法情形
逃避监管：
- 若代发工资旨在帮助委托公司逃避劳动监管，如隐瞒真实的劳动关系、规避最低工资标准、加班工资等法律规定，则此代发行为违法。此类行为剥夺了劳动者应有的劳动权益，可能面临劳动监察部门的处罚。
税务违规：
- 代发工资若涉及偷逃税款，如虚列工资支出、拆分工资以降低个税缴纳基数等，即违反了税收法律法规。例如，委托公司以较低的工资数额代发，而实际工资通过其他方式私下发放，这种行为即构成税务违法，可能面临税务部门的罚款和追缴税款等处罚。
洗钱等非法活动：
- 若代发工资被用于洗钱、转移违法所得等非法目的，则代发行为触犯刑法。犯罪分子可能利用代发工资的名义，将非法资金混入正常工资流水，以掩盖资金的非法来源。这种行为不仅违法，而且可能面临严重的刑事处罚。
法律建议
- 确保合法委托：在考虑代发工资时，务必签订合法有效的委托协议，明确双方的权利和义务，包括代发工资的金额、方式、时间、保密条款等内容。
- 遵守法律法规：代发工资过程中应严格遵守劳动法律法规和税务规定，确保准确核算工资数额，并依法代扣代缴员工的个人所得税、社会保险费等。
- 避免非法活动：切勿将代发工资用于逃避监管、税务违规或洗钱等非法活动，以免面临法律处罚和声誉损失。
总结来说，第三方代发工资的合法性取决于多个因素。在具备合法委托协议、符合劳动法规和税务规定的前提下，代发工资是合法的。然而，若缺乏正规手续或存在逃避监管、税务违规、洗钱等非法活动，则可能构成违法。因此，在考虑代发工资时，务必谨慎行事，确保自身合规运营。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。