在非法吸收公众存款案件中，总公司被立案后，分公司是否会被立案以及何时立案，需根据具体情况综合判断，无法给出确切的时间点，但可以从以下几个角度进行分析：
地域管辖因素：
- 若分公司与总公司位于不同行政区域，且分公司所在地的司法机关对分公司涉嫌的非法吸收公众存款行为具有管辖权，那么分公司可能会在其所在地被单独立案。这种情况下，立案时间取决于分公司所在地司法机关的侦查进度和证据收集情况。
犯罪行为独立性：
- 如果分公司独立开展非法吸收公众存款活动，具有独立的营销团队、吸存方案，且资金流向与总公司不混同，那么分公司可能会因其犯罪行为的独立性而被单独立案。此时，立案时间将取决于分公司犯罪行为的暴露时间、证据收集的难易程度以及司法机关的办案效率。
案件关联性：
- 若分公司的非法吸收公众存款行为是在总公司的直接指导或控制下进行的，且两者在资金、人员、业务等方面存在紧密的关联，那么司法机关可能会将两者视为一个整体进行立案侦查。在这种情况下，分公司通常不会单独立案，而是与总公司一同被立案调查。立案时间则取决于总公司案件的侦查进度和整体案件的复杂性。
司法效率与案件处理策略：
- 司法机关在处理非法吸收公众存款案件时，会综合考虑案件的复杂性、社会影响以及司法资源等因素。如果单独立案有助于提高办案效率、精准打击犯罪，并确保罪责相适应，那么司法机关可能会选择对分公司单独立案。反之，如果合并立案更有利于案件的整体处理和社会稳定，那么分公司可能不会单独立案。立案时间因此也会受到司法机关案件处理策略的影响。
法律建议：
- 对于涉及非法吸收公众存款案件的公司或个人，应积极配合司法机关的调查工作，如实提供相关证据和信息，以争取从轻或减轻处罚。
- 如果分公司可能面临单独立案的情况，建议尽早咨询专业律师，了解相关法律风险和应对策略，以便及时采取措施保护自身合法权益。
- 在案件处理过程中，应关注司法机关的办案进度和证据收集情况，及时与律师沟通，以便根据案件进展调整应对策略。
可能后果：
- 如果分公司被单独立案，将面临独立的刑事侦查、起诉和审判程序，可能承担相应的刑事责任。
- 即使分公司未被单独立案，如果与总公司存在紧密关联，仍可能因总公司的犯罪行为而受到牵连，承担相应的法律责任。
综上所述，非法吸收公众存款案件中总公司被立案后，分公司是否会被立案以及何时立案，取决于多种因素的综合考量。建议相关当事人密切关注案件进展，及时咨询专业律师，以便根据具体情况采取合适的应对措施。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。