员工离职时，公司扣工资是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法扣工资的情形
员工存在过错导致公司损失
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因员工本人原因给公司造成经济损失的，公司可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从员工本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 举例：员工因疏忽大意导致公司货物损坏，需赔偿损失。公司可与员工协商，从其工资中扣除相应赔偿金额，但需遵守上述扣除比例和最低工资标准的规定。
员工违反公司规章制度或劳动合同约定
- 若公司规章制度或劳动合同中明确规定了员工离职时需扣除的款项（如培训费、违约金等），且这些规定不违反法律法规的强制性规定，公司可依法扣除。
- 举例：公司为员工提供了专业培训，并签订了服务期协议，约定员工在服务期内离职需支付违约金。若员工在服务期内离职，公司可依据协议扣除相应违约金。
二、非法扣工资的情形
无合法理由扣除工资
- 若公司无法提供员工存在过错或违反规定的证据，仅以员工离职为由扣除工资，则属于非法扣除。
- 举例：员工因个人原因提出离职，公司无合理理由扣除其工资，员工可依法维权。
扣除金额超过法定比例或最低工资标准
- 如前所述，即使员工存在过错需赔偿损失，公司扣除的金额也不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 举例：员工当月工资为5000元，公司因员工过错需扣除赔偿金1500元。但扣除后员工剩余工资为3500元，若当地月最低工资标准为4000元，则公司需按最低工资标准支付员工工资，不得扣除全部1500元。
以其他非法理由扣除工资
- 如公司以员工未提前通知离职、未办理离职手续等为由扣除工资，但这些理由并非法律法规或劳动合同约定的合法扣除理由，则属于非法扣除。
三、员工应对措施
与公司协商
- 员工可首先与公司协商，了解扣除工资的具体原因和依据，要求公司提供相关证据和规章制度。
向劳动监察部门投诉
- 若协商无果，员工可向当地劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门介入调查并处理。
申请劳动仲裁
- 员工还可向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司支付被扣除的工资及可能产生的经济补偿金。
总结来说，员工离职时公司扣工资是否合法，需根据具体情况判断。若公司无法提供合法理由或扣除金额超过法定比例，则属于非法扣除。员工在遇到此类情况时，应积极与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。