离婚协议中涉及无证自建房的条款，只要符合法律规定的生效要件，即使房屋无产权证，协议内容仍可有效约束双方。但需特别注意条款设计、风险防范及履行可能性，具体建议如下：

一、协议条款的核心设计要点

1. 明确房屋基本事实
   需在协议中详细描述房屋位置（如具体地址、四至范围）、建造时间、结构、面积、当前使用状况等，并附现场照片、建房支出凭证（如购买建材的收据、施工合同等）作为附件，证明房屋系夫妻共同财产或个人财产（根据实际情况确定）。

2. 约定归属及补偿方式

   • 若房屋归一方所有，需明确另一方放弃所有权，并约定补偿金额及支付方式（如分期支付、一次性支付）；
     
   • 若房屋暂不分割（如因政策限制无法过户），可约定“待房屋具备办证条件时，归XX所有，另一方需配合办理手续”，并明确违约责任（如逾期配合需支付违约金）。

3. 风险防范条款

   • 约定房屋因违建被拆除的风险承担方（如“若房屋因未取得规划许可被拆除，损失由XX承担”）；
     
   • 明确房屋被征收时的补偿分配方式（如“若遇拆迁，补偿款按XX比例分配”）。

二、协议生效的法定条件

1. 双方真实意思表示
   协议需自愿签署，无欺诈、胁迫情形。若一方主张协议无效，需举证证明签署时存在重大误解或显失公平。

2. 内容不违反法律强制性规定

   • 即使房屋无证，协议仍可约定“使用权归属”，但需避免约定“所有权转让”（因无证房屋无法办理物权变更登记）；
     
   • 不得约定逃避债务、损害第三方利益的内容（如“房屋归XX所有，但对外仍以夫妻名义共同负债”）。

3. 形式要件
   离婚协议需书面签署，并经民政部门备案（协议离婚时）或法院确认（诉讼离婚时）。未备案的协议仅对双方有约束力，但无法对抗第三人。

三、实务中的常见风险及应对

1. 房屋被认定为违建的风险

   • 若房屋未取得建设工程规划许可证，可能被认定为违法建筑，面临拆除或没收风险。此时协议中约定的“归属”可能无法履行，但补偿条款仍有效（如一方已支付补偿款，可要求返还）。
     
   • 应对建议：在协议中增加“若房屋被认定为违建，XX方需返还已收补偿款”的条款。

2. 一方反悔不履行协议

   • 若房屋归一方所有，但另一方拒不腾退，可凭离婚协议向法院起诉要求排除妨害；
     
   • 若涉及补偿款支付纠纷，可申请强制执行。

3. 涉及第三方权益

   • 若房屋系家庭共有财产（如与父母共建），需其他共有人签字确认协议内容，否则可能因侵害第三方权益被认定无效。

四、示例条款（供参考）

“位于XX市XX区XX路XX号的自建房（无产权证，建造于20XX年，面积约XX平方米），双方约定归甲方所有，乙方放弃所有权。甲方于20XX年XX月XX日前向乙方支付补偿款人民币XX万元。若该房屋因政策原因被拆除或征收，补偿款全部归甲方所有，乙方不得主张权利。双方承诺，本协议签署后积极配合办理与房屋相关的手续，不得以任何理由反悔或阻碍对方行使权利。”

最后提醒：无证自建房的分割因政策差异较大（如部分地区允许补办手续，部分地区直接拆除），建议签署协议前咨询当地规划部门或律师，评估房屋合法性及履行可能性。若有进一步疑问，可直接向我咨询具体条款设计。