针对您提出的“出租车非法营运且改装，交警查住了是否要扣分”的问题，结论如下：

1. 非法营运的处罚：

   • 非法营运，即未取得营运许可而擅自从事客运经营的行为，这主要违反的是道路运输管理方面的法规，而非直接的交通法规。因此，非法营运本身通常不会直接导致驾驶证扣分。但是，非法营运会面临交通行政执法部门的严厉处罚，包括但不限于罚款、没收违法所得、暂扣或吊销营运证件等。

2. 车辆改装的处罚：

   • 车辆改装，特别是如果改装未经过相关部门批准或违反了车辆安全标准，则可能构成违法行为。根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，如果车辆改装被认定为违法，且该违法行为与驾驶行为直接相关（如改装影响车辆安全性能），则可能会面临驾驶证扣分的处罚。具体扣分情况会根据改装的性质、严重程度以及是否造成实际危害等因素来综合判断。

3. 交警查处的综合处理：

   • 当交警查处到出租车非法营运且改装的情况时，他们会根据现场情况、相关证据以及法律法规的规定，对违法行为进行综合处理。这可能包括但不限于对非法营运行为的行政处罚、对改装行为的处罚（如果构成违法），以及如果涉及其他交通违法行为（如超速、闯红灯等）的相应处罚。
   • 在处理过程中，如果改装行为被认定为违法且与驾驶行为直接相关，那么驾驶证扣分是可能的后果之一。

法律建议：

• 如果您或您认识的出租车司机面临此类情况，建议立即停止非法营运行为，并尽快将车辆恢复至合法状态。
• 积极配合交通执法部门的调查和处理工作，如实说明情况，提供相关证据。
• 如果对处罚决定有异议，可以在法定期限内依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。

可能的后遗症：

• 非法营运和违法改装行为不仅可能导致经济上的损失（如罚款、没收违法所得等），还可能对个人声誉和职业生涯造成负面影响。
• 如果因改装行为导致交通事故或安全隐患，还可能面临更严重的法律责任和刑事处罚。

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