核心结论：若网贷还款被担保公司扣除，能否追回及如何追回需视具体情况而定，主要可从担保公司扣款合法性、协商解决、法律途径等角度分析和处理。以下是具体情况说明：

1. 判断担保公司扣款的合法性

   • 合法扣款情形：如果借款人与担保公司签订的担保合同中明确约定，在借款人出现逾期还款等违约情形时，担保公司有权直接从借款人账户中扣划相应款项用于偿还网贷债务，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么担保公司的扣款行为可能是合法的。在这种情况下，借款人一般难以直接追回被扣除的款项，因为这是基于双方合同约定的合法权利行使。不过，借款人可以要求担保公司提供详细的扣款明细，包括扣款的金额、时间、用途等，以确保扣款金额与实际应还款金额相符。
   • 非法扣款情形：若担保公司扣款没有合法依据，例如未经借款人同意擅自扣款、扣款金额超出合同约定范围、扣款行为违反了相关法律法规（如侵犯了借款人的财产权、违反了金融监管规定等），则担保公司的扣款行为属于非法行为。此时，借款人有权要求担保公司返还被扣除的款项。

2. 与担保公司协商解决

   • 友好沟通：在发现还款被担保公司扣除后，借款人应第一时间与担保公司取得联系，以友好、理性的态度与对方沟通。向担保公司说明情况，要求其解释扣款的原因和依据，并表达自己对扣款行为的异议。如果担保公司承认扣款存在错误或不合理之处，可能会主动退还被扣除的款项。
   • 协商还款方案：如果扣款是因为借款人确实存在逾期还款等违约情况，但借款人认为担保公司的扣款方式或金额存在问题，可以与担保公司协商制定合理的还款方案。例如，要求担保公司调整还款计划、延长还款期限、减免部分费用等，以减轻自己的还款压力，同时也避免进一步的纠纷。

3. 通过法律途径追回钱款

   • 向监管部门投诉：如果担保公司的扣款行为违反了相关金融监管规定，借款人可以向当地的金融监管部门（如银保监会、地方金融监管局等）进行投诉。监管部门会对担保公司的行为进行调查核实，如果发现其存在违规行为，会依法对其进行处罚，并责令担保公司退还被非法扣除的款项。
   • 提起民事诉讼：如果与担保公司协商无果，且担保公司的扣款行为明显侵犯了借款人的合法权益，借款人可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼。在诉讼过程中，借款人需要提供相关证据，如借款合同、担保合同、扣款凭证、与担保公司的沟通记录等，以证明担保公司的扣款行为违法或不当。法院会根据事实和法律规定作出判决，如果判决支持借款人的诉讼请求，担保公司将被责令返还被扣除的款项，并可能需要承担相应的赔偿责任。