在国家二级保护区内租厂房仓库是否违法，需分情况讨论：

1. 若租赁行为本身符合保护区规划及用途：

   • 国家二级保护区通常对区域内的建设活动、土地利用等有特定规划。如果租赁的厂房仓库是保护区规划内允许存在的设施，且租赁行为没有违反保护区的管理规定（如未改变土地用途、未破坏生态环境等），那么这种租赁行为一般是合法的。
   • 法律依据：虽然直接针对国家二级保护区租赁行为的法律条款可能并不明确，但根据《中华人民共和国自然保护区条例》等相关法律法规，保护区内的活动需遵循保护优先、合理利用的原则，且不得破坏自然资源和生态环境。若租赁行为符合这些原则，则可视为合法。

2. 若租赁行为违反保护区规划或用途：

   • 如果租赁的厂房仓库原本就不属于保护区规划内的设施，或者租赁行为导致了土地用途的改变、生态环境的破坏等，那么这种租赁行为就是违法的。
   • 法律后果：根据违法行为的严重程度，可能会面临责令停止违法行为、限期恢复原状、罚款等行政处罚。如果情节严重，构成犯罪的，还可能依法追究刑事责任。
   • 具体情形：例如，在保护区内擅自建设厂房仓库，或者将原本用于农业生产的土地改为工业用地进行租赁等，都属于违法行为。

3. 特殊情况下的租赁行为：

   • 在某些特殊情况下，即使租赁行为本身看似符合保护区规划，但如果存在其他违法因素（如租赁合同无效、租赁双方存在欺诈行为等），也可能导致租赁行为被认定为违法。
   • 建议：在签订租赁合同前，应仔细审查合同条款，确保合同内容合法有效。同时，也可以咨询当地自然资源部门或法律专业人士，以获取更准确的法律意见。

法律建议：

• 在考虑在国家二级保护区内租赁厂房仓库时，务必先了解清楚保护区的规划及用途限制。
• 咨询当地自然资源部门或相关管理部门，获取关于租赁行为的合法性意见。
• 签订租赁合同前，务必仔细审查合同条款，确保合同内容合法、有效且符合保护区的管理规定。
• 如遇法律纠纷或疑问，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。