当汽车与两轮电动车相撞，并且交警部门已经认定双方承担主次责任时，关于修车费的承担问题，我们可以依据相关法律法规来详细解析。
一、责任划分与赔偿原则
责任划分：
- 主责方：通常承担70%至90%的赔偿责任，具体比例由交警根据事故情况确定。
- 次责方：承担剩余比例的赔偿责任。
赔偿原则：
- 首先，由交强险在限额内全额赔付，这部分是不分责任比例的。交强险的赔偿限额通常包括死亡伤残赔偿限额、医疗费用赔偿限额和财产损失赔偿限额。
- 超出交强险赔偿限额的部分，再按照主次责任的比例进行分担。
二、修车费的承担
修车费属于财产损失赔偿范畴，其承担方式如下：
交强险赔付：
- 如果汽车方有交强险，那么电动车方的修车费（在交强险财产损失赔偿限额内，通常是2000元）将由汽车方的交强险全额赔付。
- 如果电动车方也有交强险（且该电动车被认定为机动车但未购买交强险的情况除外，此时需电动车方在交强险限额内先行赔付），并且汽车方的修车费也在其交强险财产损失赔偿限额内，那么汽车方的修车费也将由电动车方的交强险赔付一部分（但实际操作中，由于汽车损失通常较大，这部分可能不足以完全覆盖汽车方的修车费）。
超出交强险部分的分担：
- 如果修车费超出了交强险的财产损失赔偿限额，那么超出的部分将按照主次责任的比例进行分担。
- 例如，如果汽车方的修车费总额为5000元，交强险赔付了2000元，那么剩余的3000元将按照主次责任比例分担。如果汽车方承担70%的责任，那么汽车方需要自行承担2100元（3000元*70%），而电动车方需要承担900元（3000元*30%）。同理，如果电动车方也有修车费，并且超出了其交强险的赔偿限额（如果有的话），也将按照同样的原则进行分担。
三、赔偿流程与注意事项
报案与定责：
- 事故发生后，应立即报警并保护现场，等待交警到来并出具责任认定书，明确主次责任比例。
保险理赔：
- 向各自的保险公司报案，并提交相关材料（如事故责任认定书、修车发票等）进行理赔。
- 优先使用交强险进行赔付，超出部分再按照责任比例进行分担。
协商调解：
- 如果双方对赔偿金额有争议，可以申请交警部门或人民调解委员会等第三方机构进行调解。
诉讼维权：
- 如果调解不成，可以向法院起诉并提供相关证据（如医疗记录、工资流水、修车发票等）来维护自己的权益。
注意事项：
- 保留好所有与事故相关的证据材料，如事故责任认定书、修车发票、医疗费用单据等。
- 注意诉讼时效问题，人身伤害索赔诉讼时效为三年，财产损失为两年。
- 如果电动车被认定为机动车但未投保交强险，次责方（电动车方）需在交强险限额内先行赔付对方损失。
综上所述，汽车与两轮电动车相撞后修车费的承担问题需要根据责任划分、交强险赔付以及超出部分的分担原则来综合处理。希望这些信息能帮助您更好地理解和处理此类事故。