针对“国家禁令占用耕地进行光伏项目却仍违法占地，法院会怎么判决”这一问题，核心在于明确违法占地行为在法律上的定性及相应法律后果。以下分情况说明法院可能的判决方向：

1. 若违法占地行为被认定为行政违法，法院可能判决撤销或变更行政处罚决定，或确认行政行为违法
   根据《土地管理法》第七十七条、第七十九条，未经批准或骗取批准非法占用土地的，由县级以上政府自然资源主管部门责令退还土地、限期拆除或没收地上建筑物，并处罚款。若行政机关已作出处罚（如罚款、责令拆除），但当事人对处罚的合法性、合理性存疑（如认为处罚程序违法、证据不足），可提起行政诉讼。法院将审查行政行为的合法性：

   • 若行政行为程序合法、证据充分、适用法律正确，法院会驳回原告诉求；
     
   • 若行政行为存在程序违法（如未告知听证权利）、事实认定错误（如错误认定占地面积）或法律适用错误（如混淆“耕地”与“未利用地”），法院可能判决撤销或变更处罚决定，或确认行政行为违法并责令重新处理。

2. 若违法占地行为构成刑事犯罪（非法占用农用地罪），法院将依法追究刑事责任
   根据《刑法》第三百四十二条，违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大（如非法占用基本农田5亩以上或基本农田以外的耕地10亩以上），造成耕地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金。若光伏项目存在以下情形，可能触犯该罪：

   • 未取得用地审批手续，强行占用耕地建设光伏设施；
     
   • 以“临时用地”名义长期占用耕地，或超出批准范围占用耕地；
     
   • 占用耕地后改变土地用途（如将耕地转为建设用地用于光伏设备安装）。
     法院审理时，会重点审查占地行为是否符合“数量较大”“造成毁坏”的入罪标准，以及行为人是否具有主观故意（如明知是耕地仍强行占用）。若构成犯罪，除对直接责任人员判处刑罚外，还可能判决责令恢复土地原状、赔偿损失等。

3. 若违法占地行为涉及民事侵权，法院可能判决停止侵害、恢复原状或赔偿损失
   若光伏项目占用耕地导致周边农户或集体经济组织权益受损（如耕地被破坏无法耕种、土地收益减少），受损方可提起民事诉讼，要求侵权方承担民事责任。法院将根据《民法典》第一千一百六十五条（过错责任原则）、第一千二百二十九条（环境污染和生态破坏责任）等规定，审查侵权行为与损害结果之间的因果关系，判决侵权方：

   • 停止侵害（如立即停止施工、拆除违法建筑）；
     
   • 恢复原状（如将耕地复垦至可耕种状态）；
     
   • 赔偿损失（如赔偿耕地减产损失、复垦费用等）。

总结与建议：法院的判决需结合具体案情，包括占地性质（是否为耕地）、占地规模、是否取得审批、是否造成实际损害等。若您涉及此类纠纷，建议收集用地审批文件、现场照片、评估报告等证据，明确诉求方向（行政诉讼、刑事控告或民事赔偿），以便更精准地维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。