公立医院在采购机器时，主要适用的法律是《中华人民共和国政府采购法》及其相关实施条例。以下是对这一问题的详细解答：

首先，我们需要明确公立医院是否属于政府采购的适格主体。根据《政府采购法》第二条第二款的规定，政府采购的主体包括各级国家机关、事业单位和团体组织。公立医院作为公益二类事业单位，显然属于这一范畴，因此是政府采购的适格主体。

接下来，我们需要判断公立医院采购机器所使用的资金性质。根据《政府采购法实施条例》第二条的规定，政府采购所使用的资金是财政性资金，即纳入预算管理的资金。这意味着，无论资金来源是财政拨款、单位自筹、经营收入还是其他形式，只要这些资金被纳入预算管理，就视为财政性资金。公立医院作为预算单位，其所有收支，包括自有收入，都应纳入部门预算管理。因此，公立医院使用自有收入采购机器，如果这笔采购属于依法制定的集中采购目录以内或者采购限额标准以上的货物，那么这一行为就应当适用《政府采购法》。

此外，对于公立医院采购的医疗设备，无论是国产还是进口，无论是国内招标还是国际招标，都应统一执行政府采购相关法律规定。这是因为医疗设备采购通常涉及公共利益和公共安全，需要受到严格的监管和规范。

最后，值得注意的是，近年来国家卫生健康委员会以及多地财政部门都印发了相关通知，进一步明确和加强了公立医院政府采购的管理工作。这些通知要求公立医院严格依法采购，加强政府采购预算管理，确保采购活动的公开、公平、公正和透明。

综上所述，公立医院在采购机器时，如果采购行为属于依法制定的集中采购目录以内或者采购限额标准以上的货物，且所使用的资金为纳入预算管理的财政性资金，那么就应当适用《中华人民共和国政府采购法》及其相关实施条例。