关于协议部门和用人部门谁承担体检费用的问题，这主要取决于具体的体检情境以及相关的法律法规或单位规定。以下是我为您提供的详细分析：

首先，我们需要明确体检的类型和目的。体检可能涉及入职体检、在职体检或离职体检，每种体检的费用承担原则可能有所不同。

1. 入职体检：

   • 通常情况下，入职体检是用人单位为了确保新员工身体健康，能够胜任工作而进行的。因此，入职体检的费用一般由用人单位承担。但这也并非绝对，具体还需看用人单位的规定或双方签订的协议内容。

2. 在职体检：

   • 在职体检可能是用人单位为了定期了解员工健康状况而进行的。这类体检的费用承担也通常由用人单位负责，但同样可能受到单位规定或协议的影响。

3. 离职体检：

   • 对于离职体检，费用承担原则更为明确。如果劳动者从事的是接触职业病危害的作业，根据相关法律法规，离职体检的费用应当由用人单位承担。这是为了证明劳动者离职时的身体状况，便于区分责任。
   • 如果劳动者所从事的岗位不属于国家规定的有毒有害岗位，即不存在职业危害因素，那么用人单位没有义务为其进行离职体检。这种情况下，如果劳动者自行选择进行体检，费用应当由劳动者自己承担。当然，如果用人单位出于某种考虑自愿承担，那则是用人单位的额外福利。

4. 特殊情境：

   • 在某些特殊情境下，如事业单位招聘等，体检费用可能由考生自行负担，但也有一些特殊情况（如低保保障家庭、建档立卡脱贫家庭人员和防返贫监测对象）可能由招聘单位承担。这主要取决于具体的招聘公告或单位规定。

关于协议部门和用人部门的责任：

• 在大多数情况下，协议部门（如人力资源部门或招聘部门）会负责制定体检政策和流程，而用人部门则负责执行这些政策。因此，体检费用的承担通常会在协议或单位规定中明确，由哪个部门（通常是用人单位整体）来承担。
• 如果协议或单位规定中未明确说明，或者存在争议，那么可能需要双方协商解决，或者依据相关法律法规进行判断。

建议：

• 如果您是劳动者，建议在入职前或体检前与用人单位明确体检费用的承担问题，并查看相关协议或单位规定。
• 如果您是用人单位，建议在制定体检政策时明确费用承担原则，并在协议或单位规定中予以体现，以避免后续争议。

综上所述，体检费用的承担问题需要根据具体情况和相关法律法规或单位规定来确定。希望以上分析能对您有所帮助。