结论：业主违规建小院报警不管，再以破坏树木原因报警是否会被立案，这取决于多个因素，包括破坏树木的行为是否构成违法犯罪、证据是否充分以及公安机关的立案标准等。以下从不同角度进行分析：
一、破坏树木行为是否构成违法犯罪
行政违法：如果破坏树木的行为尚未达到刑事犯罪的程度，但违反了《中华人民共和国森林法》等相关行政法规，如未经许可砍伐、毁坏树木等，那么该行为可能构成行政违法。在此情况下，公安机关或林业主管部门有权依据相关法律法规对违法行为人进行行政处罚，如罚款、责令补种树木等。但单纯的行政违法并不直接导致刑事立案。
刑事犯罪：如果破坏树木的行为情节严重，如数量较多、价值较大或造成严重后果等，可能构成《中华人民共和国刑法》中的故意毁坏财物罪或其他相关罪名。在此情况下，公安机关在接到报案并审查后，如果认为符合立案条件，将会依法立案侦查。
二、证据是否充分
报案材料：报案时，应提供尽可能详细的证据材料，如现场照片、视频、证人证言等，以证明破坏树木的行为确实存在以及行为人的身份。证据的充分性将直接影响公安机关是否决定立案。
公安机关调查：即使报案时提供的证据看似充分，公安机关仍需进行进一步的调查取证工作，以确认证据的真实性和合法性。如果调查过程中发现证据不足或存在矛盾，公安机关可能不会立案。
三、公安机关的立案标准
立案条件：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关立案需满足一定的条件，如认为有犯罪事实需要追究刑事责任等。如果破坏树木的行为不构成犯罪或证据不足，公安机关将不会立案。
立案程序：公安机关在接到报案后，会进行初步审查，并根据审查结果决定是否立案。如果决定立案，将依法开展侦查工作；如果决定不立案，将告知报案人并说明理由。
四、针对您情况的建议
收集证据：在报案前，应尽可能收集与破坏树木行为相关的证据材料，如现场照片、视频、证人证言等。这些证据将有助于证明破坏行为的存在以及行为人的身份。
详细陈述：在报案时，应向公安机关详细陈述破坏树木的行为过程、时间、地点以及行为人的特征等信息。这些信息将有助于公安机关进行初步审查并决定是否立案。
跟进案件：如果公安机关决定立案，应积极配合公安机关的侦查工作，提供必要的协助和支持。如果公安机关决定不立案，可以了解不立案的理由，并根据情况考虑是否申请复议或向其他相关部门反映情况。
最后，业主违规建小院和破坏树木是两个独立的行为，虽然它们可能发生在同一地点或涉及同一业主，但它们的法律性质和后果是不同的。因此，在报案时，应分别针对这两个行为进行陈述和提供证据。如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。