结论：破产企业小区收取停车费是否合理，需根据小区土地使用权归属、管理权归属以及破产管理人的职责和权限等多个因素综合判断。以下从不同角度进行详细分析：
一、小区土地使用权归属
若小区土地使用权归全体业主所有：
- 在这种情况下，小区内的停车位通常也归全体业主共有。
- 破产企业作为小区的原管理方或开发商，在破产清算后，若其不再拥有小区的管理权或土地使用权，则无权收取停车费。
- 若破产管理人或相关方未经业主大会同意，擅自收取停车费，则可能构成侵权，业主有权要求停止侵权并返还费用。
若小区土地使用权归破产企业所有，但已设定抵押或存在其他权利限制：
- 在这种情况下，破产企业虽然拥有土地使用权，但可能因抵押或其他权利限制而无法自由处置。
- 收取停车费需考虑抵押权人的意见以及相关法律法规的规定，可能需经过特定程序或获得相关批准。
二、小区管理权归属
若小区已成立业主大会并选聘了新的物业服务企业：
- 在这种情况下，小区的管理权已转移至新的物业服务企业。
- 破产企业或其破产管理人无权再收取停车费，除非与新的物业服务企业有特别约定且该约定符合法律法规的规定。
若小区尚未成立业主大会或未选聘新的物业服务企业：
- 在这种情况下，小区的管理权可能仍由破产企业或其破产管理人暂时行使。
- 但收取停车费仍需遵循相关法律法规的规定，如需经过业主大会同意或符合政府指导价等。
三、破产管理人的职责和权限
破产管理人的职责：
- 破产管理人负责破产企业的财产管理和处分工作，包括清理破产企业财产、编制财产清单、处理破产企业的债权债务等。
- 在收取停车费的问题上，破产管理人需确保其行为符合法律法规的规定，且不得损害债权人的利益。
破产管理人的权限：
- 破产管理人的权限来源于法院的指定和法律法规的规定。
- 在收取停车费的问题上，破产管理人需有明确的法律依据或法院的批准，否则可能构成超权限行为。
四、实际操作建议
对于业主：
- 若对破产企业小区收取停车费有异议，可首先查阅小区的土地使用权归属和管理权归属情况。
- 若认为收取停车费不合理，可向业主大会反映情况，或通过法律途径维护自己的合法权益。
对于破产管理人：
- 在收取停车费前，应确保自己有明确的法律依据或法院的批准。
- 应与业主大会或相关方进行充分沟通，确保收取停车费的行为符合法律法规的规定和业主的利益。
进一步思考：在处理破产企业小区收取停车费的问题时，还需考虑当地政府的政策导向和监管要求。不同地区可能对破产企业小区的管理和收费有不同的规定和标准，因此在实际操作中需结合当地的具体情况进行判断。若您对此类问题有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。