针对您提出的“残联违规办证案件怎么处理”的问题，这确实是一个涉及残疾人权益保障和残联工作规范性的重要议题。以下是我根据相关政策和实践，为您提供的详细解答：

一、违规办证案件的纠治重点

残联在处理违规办证案件时，主要关注以下几个方面：

1. 审批程序违规：在残疾等级评定、申请材料审核、残疾人证审批等过程中，未履行规定审批程序，或利用职务便利插手干预评定，提高、降低甚至虚构残疾等级，为不符合条件的申请人违规办理残疾评定手续。

2. 中介机构操纵：为申请人搞定评估等级或违规办证提供帮助，或通过特定中介机构收取办证“手续费”，操纵评定结果，损害残疾评定工作的公正性。

3. 虚假评定报告：违规出具虚假残疾评定报告，篡改、伪造医疗记录，为申请人量身定制虚假评定结论。

4. 申请人骗取资格：申请人通过伪造病历、虚构残疾成因、伪装残疾状况或借用他人残疾证明材料、在无资质机构获取虚假诊断证明，骗取残疾评定资格，获取相关补贴及衍生权益。

二、违规办证案件的处理流程

1. 主动申报与自查自纠：

   • 残联会发布通告，要求存在违规持有残疾人证情形的人员（包括党政机关、企事业单位干部职工、乡、镇(村居)工作人员、广大党员及其直系亲属）主动申报，并配合证件注销、等级重新鉴定、退还违规领取惠残资金等工作。
   • 申报方式多样，包括向所在单位党组织现场或书面申报、向所在乡、镇(村居)党组织申报、直接到县残联现场申报或电话申报等。

2. 线索举报与受理：

   • 残联会公开受理相关问题线索举报，包括违反规定程序办理残疾人证、残疾评定弄虚作假、侵占挪用惠残资金等问题。
   • 举报方式包括电话举报和来信举报，举报人应实事求是反映问题，提供明确举报对象、发生时间、具体问题及相关佐证材料。

3. 调查核实与处理：

   • 残联会对收到的申报和举报线索进行调查核实，根据调查结果依规依纪依法进行处理。
   • 对于主动如实申报并积极配合清理纠治的人员，会争取从轻、减轻或免予处理。
   • 对于逾期不主动申报、隐瞒不报、弄虚作假或拒不配合清理纠治的人员，一经核查发现，将依规依纪依法严肃追责问责；涉嫌违纪违法的，将移交纪检监察机关处理。

三、预防与监督机制

1. 加强宣传教育：残联会通过多种渠道加强残疾人证办理政策的宣传教育，提高公众对残疾人证办理程序和要求的认识，减少违规办证的发生。

2. 完善审批程序：残联会进一步完善残疾人证办理的审批程序，加强审核把关，确保审批过程公开、透明、规范。

3. 强化监督问责：残联会建立健全监督问责机制，对违规办证行为进行严肃查处，并公开曝光典型案例，形成震慑效应。

四、建议与呼吁

1. 建议公众积极参与监督：公众应积极参与对残联工作的监督，发现违规办证行为及时举报，共同维护残疾人事业的清朗健康发展。

2. 呼吁残疾人及其家属自觉遵守规定：残疾人及其家属应自觉遵守残疾人证办理的相关规定，不伪造、不虚构、不借用他人残疾证明材料，共同维护残疾人证的严肃性和公正性。

综上所述，残联在处理违规办证案件时，会采取主动申报与自查自纠、线索举报与受理、调查核实与处理等措施，并加强预防与监督机制建设。同时，也呼吁公众积极参与监督，共同维护残疾人事业的健康发展。