做手术请病假期间，工资是否会被扣除需根据具体情况判断，但无论如何都不能违反法律法规的规定和员工的合法权益。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律规定的医疗期

根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，会根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予3个月到24个月的医疗期。具体规定如下：

• 实际工作年限10年以下的，在本单位工作年限5年以下的为3个月；5年以上的为6个月。
• 实际工作年限10年以上的，在本单位工作年限5年以下的为6个月；5年以上10年以下的为9个月；10年以上15年以下的为12个月；15年以上20年以下的为18个月；20年以上的为24个月。

在医疗期内，员工享有病假工资或疾病救济费，这是员工的合法权益。

二、病假工资的支付标准

根据《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》，职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费。具体规定如下：

• 病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。
• 病假工资的支付比例可能因地区规定、单位规章制度以及劳动合同约定而有所不同，但任何情况下都不能低于当地最低工资标准的80%。

举例说明：假设某地区最低工资标准为2000元/月，那么员工在医疗期内的病假工资或疾病救济费至少应为1600元/月（2000元×80%）。

三、特殊情况处理

• 如果员工请病假的天数超过了法律规定的医疗期，单位可以根据自身的规章制度以及与员工签订的劳动合同来决定是否扣除工资以及扣除的比例等。但相关制度和操作必须符合法律法规的规定，不能随意侵害员工的合法权益。
• 若医疗期满员工仍不能工作，单位可以解除劳动关系，并应按照劳动者在本单位的工作年限支付经济补偿。具体为：每满一年支付一个月工资的经济补偿；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。

四、实际操作建议

• 员工在请病假时，应确保提供病历等相关通知单，以证明其病假的合法性。这是维护自己合法权益的重要步骤。
• 单位在处理员工病假工资时，应严格遵守相关法律法规和规章制度，确保员工的合法权益不受侵害。如果单位存在违法行为，员工有权向劳动部门投诉或寻求法律援助。
• 如遇特殊情况或疑问，建议及时咨询，以获取最准确的法律建议和指导。

综上所述，做手术请病假期间的工资发放情况需根据具体情形确定。在医疗期内，员工享有病假工资或疾病救济费，且不得低于当地最低工资标准的80%。如果请病假天数超过医疗期，单位需根据规章制度和劳动合同决定是否扣除工资及扣除比例。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。