当在高速公路上遇到飞来的石头砸到车的情况时，您可以按照以下步骤来处理，以确保自身安全并维护自身权益：

一、确保现场安全

1. 保持冷静并开启双闪：首先，务必保持冷静，不要惊慌失措。立即开启危险报警闪光灯（双闪灯），以警示其他车辆，防止发生连环事故。

2. 转移至安全地带：在确保安全的前提下，将车辆移至应急车道或紧急停车带。如果车辆无法移动，人员应迅速撤离到高速公路护栏外的安全区域，确保人身安全。

3. 设置警示标志：在车辆后方适当距离（普通高速公路150米以外，城市快速路100米以外，夜间或恶劣天气应适当增加距离）放置三角警示牌，以提醒其他车辆注意避让。

二、检查人员伤亡与报警

1. 检查人员伤亡：迅速检查车内人员是否受伤。如有伤员，应立即拨打120急救电话，并清晰告知事故发生地点和伤员状况。

2. 立即报警：拨打高速公路报警电话（如12122或当地交警部门的紧急电话），向交警部门准确报告事故情况，包括事故发生的时间、地点、经过及原因（即被飞来的石头砸到车）。等待交警到来进行现场处理。

三、保留现场证据与通知保险公司

1. 保留现场证据：在确保安全的前提下，使用手机等设备从多个角度拍摄事故现场的照片和视频，包括车辆受损情况、石头的位置和形态、道路标识等。这些证据对后续的事故处理和理赔至关重要。

2. 通知保险公司：立即联系所投保的保险公司，报告事故情况，并按照保险公司的要求提供相关信息。保险公司会派员前往现场进行查勘定损，或指导您如何进行后续处理。

四、确定责任与索赔

1. 确定责任方：

   • 如果石头是来自前车且能找到具体车辆和责任人，可要求其赔偿。协商不成时，可以通过法律途径提起诉讼。
   • 如果石头是由于高速公路管理方存在过错（如未及时清理路面异物）导致的，根据相关法律法规，您可以向高速公路管理者索赔。

2. 配合定损与提交索赔申请：

   • 配合保险公司进行车辆定损，提供现场照片、交警出具的事故认定书等相关证据。
   • 根据保险条款尽快向保险公司提交索赔申请，并提供所需的索赔单证（如交通事故调解书、责任认定书、出险通知书、定损单、车辆修理发票及维修清单等）。

五、后续处理与注意事项

1. 维修车辆：根据保险公司的定损结果，选择合适的维修点对车辆进行维修。确保维修质量，并保存好维修记录和相关收据。

2. 持续保留证据：在整个处理过程中，务必妥善保管所有相关证据。这些证据可能在未来的法律纠纷或理赔过程中发挥关键作用。

3. 注意事项：

   • 保持冷静，确保自身和乘客安全，避免采取危险措施。
   • 如实陈述事故经过，积极配合交警和保险公司的工作。
   • 若需法律援助，应及时咨询专业律师以维护自身权益。

综上所述，当在高速公路上遇到飞来的石头砸到车的情况时，务必保持冷静并采取正确的应对措施。通过及时报警、通知保险公司、保留现场证据并寻求专业帮助，您可以更有效地维护自身权益并确保行车安全。