结论：在劳务派遣关系中，劳务派遣员工的工资一般应由劳务派遣单位发放。这是基于《中华人民共和国劳动合同法》的明确规定以及劳务派遣关系的本质所决定的。
一、法律规定与依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十八条，劳务派遣单位是本法所称用人单位，应当履行用人单位对劳动者的义务，这其中包括向被派遣劳动者按月支付劳动报酬。被派遣劳动者在无工作期间，劳务派遣单位也应当按照所在地人民政府规定的最低工资标准，向其按月支付报酬。这一条款明确规定了劳务派遣单位作为用人单位的工资支付责任。
二、具体解释与逻辑关联
劳动关系决定工资发放主体：
- 劳务派遣人员与劳务派遣单位之间建立了劳动关系，并签订了劳动合同。基于劳动关系的存在，用人单位（即劳务派遣单位）有义务按照约定向劳动者支付工资。
- 例如，小张与某劳务派遣公司签订了劳动合同，并被派遣到一家企业工作。尽管小张在企业实际工作，但他的工资仍应由劳务派遣公司发放，因为小张的劳动关系是与劳务派遣公司建立的。
劳务派遣关系的本质：
- 劳务派遣是一种特殊的用工方式，其中劳务派遣单位作为用人单位，与被派遣劳动者建立劳动关系，并负责管理、培训、发放工资等事务。
- 用工单位则通过与劳务派遣单位签订劳务派遣协议，使用被派遣劳动者的劳务，并向劳务派遣单位支付包括工资在内的相关费用。
三、实际操作中的处理
常规操作：
- 在实际操作中，用工单位通常会按照劳务派遣协议的约定，将包括劳动者工资在内的费用支付给劳务派遣单位。
- 劳务派遣单位收到款项后，会依法向劳动者发放工资，并为其缴纳社会保险等费用。
特殊情况：
- 虽然在实际操作中可能会出现用工单位代发工资的情况，但这种代发行为需要有明确的约定或特定的安排，并且不改变劳务派遣单位作为工资支付主体的法定责任。
- 如果因代发工资导致的问题，如工资未按时足额发放，劳务派遣单位仍需承担最终的法律责任。劳动者可以依法向劳务派遣单位主张权利，要求其支付工资及相应赔偿。
四、劳动者权益保护
- 若劳务派遣单位未按时足额发放工资，劳动者可以依法向其主张权利，要求支付工资及相应赔偿。
- 劳动者在遇到工资问题时，应首先尝试与劳务派遣单位协商解决；协商不成时，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼。
五、实际案例与风险提示
- 案例：某劳务派遣公司派遣员工小李到一家企业工作，但劳务派遣公司未按时足额支付小李的工资。小李在与企业沟通无果后，依法向劳务派遣公司主张权利，最终获得了应得的工资及赔偿。
- 风险提示：劳务派遣单位应严格遵守相关法律法规，确保按时足额发放工资。否则，不仅可能面临劳动者的法律诉讼，还可能受到劳动行政部门的处罚。
综上所述，劳务派遣员工的工资一般应由劳务派遣单位发放。这是基于法律规定和劳务派遣关系的本质所确定的。在实际操作中，应严格遵守相关法律法规，确保劳务派遣工资的合法、准确、及时发放，切实保障劳动者的合法权益。如果您在劳务派遣工资发放方面遇到任何问题，可以直接向我咨询。