核心结论：若电子合同无效但存在纸质合同，需根据具体情况判断纸质合同的效力及后续处理方式，具体可分为以下几种情况：

1. 纸质合同与电子合同内容一致，且纸质合同有效
   若纸质合同与电子合同内容完全相同，且纸质合同本身符合《民法典》关于合同生效的要件（如双方真实意思表示、不违反法律强制性规定等），则纸质合同可作为有效合同继续履行。此时，电子合同因无效原因（如未采用可靠电子签名、未满足法定形式要求等）被否定，但纸质合同的效力不受影响，双方应按纸质合同约定履行义务。

2. 纸质合同与电子合同内容冲突，需以有效合同为准
   若纸质合同与电子合同内容存在实质性差异（如标的、价款、履行期限等关键条款不同），需根据合同成立时间、双方真实意思表示等因素判断哪份合同有效。例如：

   • 若纸质合同签订时间在后，且能证明双方已通过纸质合同变更原电子合同内容，则以纸质合同为准；
     
   • 若无法证明哪份合同为双方最终意思表示，可能需结合交易习惯、履行情况等综合判断，甚至可能因“阴阳合同”问题导致两份合同均无效，需按法定规则处理后续事宜（如返还财产、赔偿损失等）。

3. 纸质合同本身存在无效情形
   即使电子合同无效，若纸质合同本身存在《民法典》规定的无效情形（如一方以欺诈、胁迫手段订立合同，损害国家利益；恶意串通损害他人利益；违反法律、行政法规强制性规定等），则纸质合同同样无效。此时，双方需根据无效合同的法律后果处理：

   • 返还已取得的财产；
     
   • 无法返还或没必要返还的，折价补偿；
     
   • 有过错的一方赔偿对方损失，双方均有过错的，按过错比例分担。

建议行动：

• 固定证据：立即收集纸质合同、电子合同、沟通记录、履行凭证（如付款记录、交货单等），以证明合同内容及实际履行情况；
  
• 分析无效原因：明确电子合同无效的具体原因（如签名问题、形式问题等），以及纸质合同是否存在无效情形；
  
• 协商或诉讼：根据合同效力及实际损失，与对方协商解决方案；若协商不成，可向法院起诉，请求确认合同效力并主张权利。
  

提示：合同效力问题涉及复杂法律判断，建议根据具体案情进一步分析。若有疑问，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细解答。