结论：是否能在起诉时主张违约金，关键在于合同中是否明确约定了违约金条款。若合同中有约定，则可以主张；若合同中没有约定，则一般不能直接主张违约金，但可主张逾期付款利息或其他违约责任。
详细分析：
合同中有违约金条款的情况：
- 如果双方在货物买卖合同中明确约定了货到付款的期限，并且约定了如果买方未在规定期限内付款，需要支付一定数额的违约金，那么在这种情况下，卖方在起诉时可以依据合同中的违约金条款，要求买方支付违约金。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
合同中没有违约金条款的情况：
- 如果合同中没有明确约定违约金条款，那么卖方在起诉时一般不能直接主张违约金。但是，卖方可以主张买方承担逾期付款的利息损失或者其他因违约造成的实际损失。
- 利息计算：逾期付款利息通常可以按照中国人民银行同期同类贷款利率或者全国银行间同业拆借中心公布的贷款市场报价利率（LPR）来计算。具体计算公式为：逾期付款利息 = 欠款金额 × 利率 × 逾期天数。
- 其他损失：如果卖方因买方的违约行为还遭受了其他实际损失，如因追讨货款而产生的律师费、诉讼费等，也可以要求买方进行赔偿，但需要提供相应的证据来证明这些损失的实际发生。
诉讼时效问题：
- 需要注意的是，根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。因此，如果卖方在知道或应当知道买方未付款之日起已经超过了三年，且没有诉讼时效中断或中止的情形，那么卖方可能会丧失胜诉权。但在这个案例中，由于已经两年没付款，所以诉讼时效方面通常不会构成障碍。
建议：
- 在起诉前，卖方应仔细审查货物买卖合同，确认合同中是否有违约金条款以及其他关于违约责任的约定。
- 收集并整理好相关证据，如合同、送货单、对账单、催款记录等，以证明买方的违约行为和卖方的实际损失。
- 如果对法律程序或证据收集等方面存在疑问，建议及时咨询专业律师，以确保自身权益得到有效维护。
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